華人學者Nature Methods發表CRISPR新工具
基因網路指導著細胞的正常功能,這個網路受到干擾就可能引發疾病。動態操縱轉錄組的能力對於研究基因網路的作用機制非常重要。斯坦福大學的研究人員在CRISPR–dCas9的基礎上實現了可誘導的複雜轉錄調節,這項研究發表在十月二十四日的Nature Methods雜誌上,文章通訊作者是斯坦福大學的華人學者齊磊(Lei S Qi)。齊磊是CRISPR領域的先行者之一,在Cell等頂級期刊上發表了多項突破性成果。
細菌一直在與病毒或入侵核酸進行鬥爭,為此它們演化出了多種防禦機制,CRISPR–Cas9適應性免疫系統就是其中之一。規律成簇的間隔短迴文重複CRISPR與內切酶Cas9的組合,可以在引導RNA的指引下,靶標並切割入侵者的遺傳物質。2012年研究者們利用這一特點,將CRISPR系統製成了強大的基因組編輯工具。
喪失核酸酶活性的dCas9依然可以到達目的地,只是無法進行剪切。雖然CRISPR–dCas9轉錄調控子可以控制單個基因表達,但還不能動態調節複雜的轉錄事件。現在,齊磊及其同事以dCas9為基礎打造了一個化合物誘導的轉錄調控平台。
研究人員篩選了能在哺乳動物細胞中有效激活和抑制基因的化合誘導物。他們將這些誘導物與dCas9調控子結合起來,在同一個細胞中控制不同基因的表達。這種CRISPR–dCas9平台能夠執行複雜的轉錄程序,適用於大規模轉錄組工程。
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