二代測序助力感染性疾病的精準診療

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cript>演講課件點擊下載 | 童貽剛：二代測序助力感染性疾病的精準診療

軍事醫學科學院微生物流行病研究所童貽剛教授發表了《二代測序助力感染性疾病的精確診療》的主題演講。童貽剛教授指出目前臨床微生物檢驗所存在的問題：培養陽性率低，檢測種類有限，缺乏病原體型別、致病性、耐葯信息，無法檢出罕見、未知和新發病原體。而高通量測序在篩查病原體具有著很多優勢，不依賴培養，死菌、使用抗生素的細菌亦可檢出，可同時檢出病原體型別、毒力基因、耐葯基因，準確可靠，通量大，尤其既可以發現已知病原體，又可以發現完全未知的病原體。

童教授指出隨著測序通量越來越大、測序成本大幅下降、測序速度越來越快、質量越來越高而且測序的自動化程度越來越高，高通量測序技術已經成為常規技術應用於病原體篩查。利用高通量測序進行病原體篩查最為關鍵的問題就是樣本的前處理和數據處理，在報告中，童教授展示了樣品前處理的經典的操作流程和方法，同時也分享了病原體識別的數據處理的流程和方法。

報告中，童教授分享了很多案例，如引進非洲綠猴疫情、兒童呼吸道病原體篩查、食物中毒死亡事件、未知病因肺部感染的案例等，在這些案例中都利用高通量測序發現致病微生物。同時也分享了今年 7 月，在 36 小時之內利用 Ion 高通量測序平台對首例輸入性裂谷熱病毒進行全基因組測序，以及今年 2 月份，利用 AmpliSeq 多重靶向捕獲技術解析寨卡病毒全基因組序列。2014 年，童教授及其團隊也在西非獅子山抗擊埃博拉病毒的第一線，通過對 175 個埃博拉病毒樣本進行全基因組序列測定，發現病毒的變異，進行遺傳多樣性分析、傳播分析證實其進化速率並未增加。童教授也分享了接下來，會利用超多重靶向 PCR 技術-AmpliSeq 技術應用於腹水、血液、呼吸道、消化道、腦脊液等常見微生物的篩查。

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