基因篩查顯示家族性高膽固醇血症被低估
生物探索
編者按
Science上在12月23日刊登了兩篇文章,美國Geisinger-RGC合作進行的第一篇文章發現一種稱為家族性高膽固醇血症的致命遺傳性疾病,在診斷和治療都被低估。Geisinger-RGC的被稱為DiscovEHR的另一個合作研究描述了第一個50726的成人參與者的基因組測序和分析,來篩查家族性高膽固醇血症。
Science上在12月23日刊登了兩篇文章,分別是美國Geisinger健康系統與Regeneron遺傳學中心(RGC)合作進行的研究,以及Geisinger-RGC的被稱為DiscovEHR的合作研究。Geisinger-RGC的第一篇文章「Genetic identification of familial hypercholesterolemia within asingle U.S. health care system」發現一種稱為家族性高膽固醇血症的致命遺傳性疾病,在診斷和治療都被低估。
DiscovEHR的合作研究「Distribution and clinical impact of functional variants in 50,726 whole-exomesequences from the DiscovEHR study」描述了在Geisinger mycode社區健康倡議所有成員參加的DiscovEHR中第一個50726的成人參與者的基因組測序和分析,來篩查家族性高膽固醇血症。
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高膽固醇血症被低估
家族性高膽固醇血症的缺陷,使人體無法消除血液中的「壞」膽固醇引起的。這種膽固醇(低密度脂蛋白膽固醇/LDL-C)然後不容易被察覺地積累,即使在非常年輕的人也有可能導致早期死亡的心臟病或中風。傳統上,在美國,有早期心臟病和中風家族史的高膽固醇患者被診斷為家族性高膽固醇血症。為家族性高膽固醇血症進行的基因檢測,目前在臨床上還少見。
在家族性高膽固醇血症的研究中,研究人員在DiscovEHR樣本中檢測了引起家族性高膽固醇血症的基因變異,並將這些結果與Geisinger電子健康記錄中這些患者的醫療史進行比較。
Geisinger臨床基因組學的主任Michael F.Murray大夫說:「這項研究揭示了家族性高膽固醇血症是我們預想的兩倍那麼普遍。對家族性高膽固醇血症的大規模基因檢測有助於識別錯過的病例。」
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測序與電子檔案相匹配
在3個家族性高膽固醇血症的基因中,本研究發現每256個人中的1個人會有一個致病突變或變異。研究顯示攜帶家族性高膽固醇血症有害變異的參與者比那些沒有的人「壞」的膽固醇要高得多,他們也有著一般和早發性冠心病增加的可能。
RGC遺傳學副主任Noura Abul Husn大夫說:「能夠將病人的已識別的醫療記錄與他們的DNA數據聯繫起來,是該領域很少有人擁有的一個優勢。用RGC的獨特的技術和分析資源類配對,讓我們能夠做出有意義的發現,可能會在今天提前實施精準醫學的和在明天開發新的或改進的藥物。」
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兩篇文章的篩查結果
第一篇研究「Genetic identification of familial hypercholesterolemia within asingle U.S. health care system」在LDLR, APOB和PCSK9這三個已被確認導致家族性高膽固醇血症的基因中確定了35個突變或變異。只有24%的攜帶引起家族性高膽固醇血症的變異的人,在他們的電子健康記錄中有家族性高膽固醇血症的確診。這意味著如果不用基因確認的話,很多這樣的病人將未被診斷或治療。事實上,42%的攜帶導致家族性高膽固醇血症的變異的人並沒有服用他汀類藥物來降低膽固醇。在服用他汀類藥物的攜帶導致家族性高膽固醇血症的變異的人中,少於一半達到降低膽固醇的目標。
「Distribution and clinical impact of functional variants in 50,726whole-exome sequences from the DiscovEHR study」則對50726名成人患者的外顯子在DiscovEHR的外顯子進行了測序,確定約420萬罕見的單核苷酸變異和插入/刪除事件,其中約176000預計將導致基因功能喪失的。將這些數據與電子病歷來源的臨床表型相聯繫,研究人員發現臨床協會支持的治療靶點,其中包括編碼降脂藥物的靶基因,並發現以前未知的稀有等位基因和與血脂水平和其他血液性狀相關的基因。在76個臨床可操作的基因中,約3.5%的個人攜帶有害的變異。
Geisinger執行副總裁兼首席科學官David H.Ledbetter博士說:「Geisinge致力於將這一重要的研究直接轉化為對患者更好的護理。我們已經開始盡最大努力在疾病基因篩查中確認人群中發現的病人,並通知參與者個人和他們的醫生。」
參考資料
Genetic identification of familial hypercholesterolemia within a single U.S. health care system
Distribution and clinical impact offunctional variants in 50,726 whole-exome sequences from the DiscovEHR study
MyCode study finds familia hypercholesterolemia is under diagnosed, under treated
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