NIPT發展方向：其它常染色體異常和CNVs異常

懷孕 07-05

本文來自「生物醫藥行業動態」微信號

作者：王小樂

上周，瑞士生物信息研究所以及幾個生物基因組實驗室的研究人員在Nature出版集團旗下期刊《Genetics in Medicine》上刊登了一篇關於無創產前基因檢測（NIPT）的文章。該文章基於6388例大樣本臨床試驗、核型分析以及孕後隨訪，建議現行的NIPT產品檢測範圍應該從傳統的常見染色體異常（21、18、13號染色體）和性染色體異常檢測，擴展到其它常染色體異常和拷貝數異常（CNVs）。

NIPT是一項通過抽取孕婦的血來檢測胎兒健康狀況的技術。NIPT產品的檢測範圍目前僅僅局限在常見染色體數目異常和性染色體異常。而這部分異常只佔臨床意義明確的非整倍體異常的75%－85%。由於較低的敏感度和測序深度，是否將NIPT檢測範圍擴展到其它常染色體異常和CNVs一直都存在爭議。

儘管現行NIPT檢測產品在亞染色體水平上的檢測精準度仍然受到質疑，美國NIPT檢測公司Natera 和 Sequenom已經將檢測範圍擴展到DiGeorge綜合征、1p36 缺失綜合征、Angelman綜合征、貓叫綜合征和Prader-Willi綜合征。

驗證和隨訪

在該項研究的6388名受檢者中，共檢出258例異常，包括119例常見染色體異常、53例性染色體異常、50例其它常染色體異常和36例CNVs異常。其它6130名受檢者均為正常。

研究人員隨後通過核型分析以及孕後隨訪，對NIPT結果進行驗證。檢測結果驗證了NIPT在常見染色體異常（21、18、13染色體）的高檢出率和低假陽性率。在對常見染色體異常的檢測中，只出現了2例假陰性（均是18染色體）。一例是因為胎兒DNA濃度太低，一例可能是因為胎兒嵌合體。

在53例性染色體異常受檢者中，38例為OX（性染色體缺失一條），10例XXX（女性多一條X染色體），5例Klinefelter綜合征 XXY（男性多一條X染色體）。研究人員對24名 OX， 4名XXX和1名 TXS進行了核型驗證，發現17例假陽性（均來自OX），0例假陰性。在對3例OX高風險受檢者隨訪發現：2例假陽性，1例臨床意義未明。

在50例其它常染色體異常受檢者中，研究人員對19名進行了核型分析和分子鑒定。3名受檢者22號染色體異常，2名16號染色體異常，6名7號染色體異常。其它7名受檢者被認為是正常二倍體。隨訪結果顯示誤診率僅為0.71%。

在36名CNVs異常受檢者中，研究人員對11名進行了核型分析、Microarry和FISH分析，確診了8例CNVs異常，有3例假陽性。後期隨訪發現1例假陰性（4號染色體10MB片段缺失）。

基於以上的檢測數據，瑞士的研究人員認為：將基於胎兒游離DNA的NIPT產品的檢測範圍擴大（從常見染色體異常和性染色體異常擴展到其它染色體異常和CNVs異常）是有必要的，這也是該類產品未來的發展方向。

原始出處：doi：10.1038/gim.2016.72

NIPT發展方向：其它常染色體異常和CNVs異常