JAMA:35萬人研究揭示產前篩查隱秘痛點—美國基因篩查指南存在嚴重漏洞
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《轉》譯
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來自全球著名基因檢測公司Counsyl的科研人員發現擴大致病基因的篩查範圍可以有效篩出傳統標準致病基因篩查無法檢出的大量疾病相關基因。
該研究的對應論文發表於最新頂尖醫學期刊JAMA,在這篇文章中,科研人員列舉大量證據證明基於美國婦產科學會,美國醫學遺傳學與基因組學學會所提供基因篩查指南的傳統致病基因篩查可能會漏檢大量與嚴重疾病發病密切相關的基因突變。同時,科研人員在這篇文章中強調學術界目前基於人群基因組學的致病基因流行病學理論存在著一些不容忽視的漏洞。
在這項研究中,科研人員共招募了35萬名不同種族背景的夫婦,這夫妻均於2012至2015年間接受了Counsyl公司的產前致病基因篩查(Family Prep Screen),分析了夫妻雙方所有常染色體中110個疾病相關基因以及X染色體上隱性致病基因的攜帶狀態。
研究人員對上述35萬人的基因數據進行了隨機配對與生育模擬,基於隨機配對假設與假想嬰兒種族劃分對上述夫妻初產嬰兒遺傳病發病率進行了計算。研究人員首先分析了同種族背景夫妻後代遺傳病的發病風險,並將之與按照美國醫學遺傳學會(ACMG)、美國婦產科學會(ACOG)提供遺傳病篩查指南所估計的發病風險做出對比。ACMG與ACOG的遺傳病篩查指南正式基於目前學術界對於不同人群致病基因頻率的有限知識擬定,ACMG與ACOG通常都會根據一個人的種族背景來為其推薦針對不同疾病的致病基因篩查。
「由於相比於基於種族背景遺傳篩查擁有更多的相關參數,同時也因為傳統基於族背景遺的遺傳篩查更依賴於人們自身對於種族與民族的認同,擴大化的致病基因篩查(expanded carrier screening)可以更加有效鑒別更多患有某一遺傳病的假想嬰兒。」文章的作者表示。
舉例來說,在德系猶太志願者中,擴大化的致病基因篩查所檢測到的假想遺傳病患兒中有55%都是ACMG與ACOG所推薦的傳統遺傳病篩查所無法檢出的。在中東人中,這一數字甚至高達91%。
另外,ACMG與ACOG所提供的傳統遺傳病篩查指南中還存在更加明顯的矛盾。對於研究更加透徹的人群來說,其致病基因檢出率必定是較為可觀的,而對於相關研究較為缺失的人群來說其根據個人種族所進行的遺傳病篩查定將是漏洞百出。不同於基於種族的遺傳病篩查,擴大化的致病基因篩查不會因為個人對自己種族的認同差異而脫離客觀實際,可以有效縮小不同種群研究深度不同所帶來的篩查差異。
Counsyl的這一研究並不是業內首次對傳統基於種族的遺傳病篩查提出質疑。去年,Good Start Genetics在一次業內會議上指出該公司基於種族的23項遺傳病篩查服務會出現16%-22%的攜帶者漏檢。
同樣,專業的社會學家也對擴大化致病基因篩查的潛在優勢表示了認同。去年,包括ACMG、ACOG、美國母胎醫學協會(Maternal Society for Maternal-Fetal Medicine)、美國遺傳諮詢協會(National Society for Genetic Counselors)以及美國圍產兒保護基金會(Perinatal Quality Foundation)在內的各大組織機構均發布了關於擴大化致病基因篩查的聯合聲明。在這一聲明中,上述各組織機構並沒有明確贊同對於推廣與普及擴大化致病基因篩查的認可,同時也不支持遺傳諮詢師和新婚夫婦根據某種特殊的遺傳病篩查指南選擇篩查服務,上述機構指出相關遺傳病篩查的供應商應清楚明了地列舉各種測試服務對於消費人群的利益與風險。
加州大學與洛杉磯分子診斷與臨床基因組學中心教授Wayne Grody在同樣出版於最新JAMA的相關評論中表示Counsyl公司的這一研究「對於產前診斷的發展具有巨大貢獻」,「 為基因變異頻率研究提供了大量有價值的數據,可以幫助成功檢測不同種族/民族背景育齡人群的致病基因攜帶風險。」然而即便如此,Grody教授同樣表示推廣和普及擴大化致病基因篩查之前,相關的研究人員仍需積累大量令人信服的證據。「特別是在令人緊張又興奮的產前診斷方面,相關的篩查項目必須以最謹慎的態度和方式執行。」Grody教授說。
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