人類外顯子組迄今最全遺傳變異記錄公布

本報記者 張夢然

近期發布的幾組研究報告顯示，科學家們正以前所未有的力度考察人類的遺傳變異。其中在一項關於人類基因組外顯子組(蛋白質編碼區)的深度分析中，研究人員提供了迄今為止有關該區域最全面的遺傳變異記錄；而在另一項研究中，科學家們改進了對基因變體的解讀。

基因組分析 外顯子組領先

除效率因素之外，還有一個重要原因是，現在人們對外顯子組的解讀能力明顯強於對全基因組的解讀。全基因組測序產生的海量數據包括了非編碼鹼基、結構和單倍型相位信息，但目前大多數核苷酸的作用仍然成謎。換句話說，外顯子組所不具備的，恰恰是現在掌控力不足的部分。

因此，當全基因組分析的成本、效率、難易程度都趕不上外顯子組時，後者在解讀「生命密碼」領域仍然魅力非凡。

最全面記錄 前所未有精細

此次，美國哈佛—麻省理工博德研究所丹尼爾·麥克阿瑟參與了人類外顯子組整合資料庫(ExAC)的項目，他與同事們分析了60706位被試者的外顯子組測序數據，這些被試者來自包括歐洲、非洲、南亞、東亞和拉美在內的不同地理人口系譜。研究中發現了約740萬個遺傳子多態，對人類低頻蛋白質編碼多態的分析，其解析度達到前所未有的程度。

麥克阿瑟團隊通過分析該數據集來表徵全球遺傳變異的模式，在較小的遺傳變異數據集上達到了此前無法實現的解析度，遺傳變異密度令他們得以在同一位點分辨多重序列多態，而數據集的規模則令團隊首次獲得一些有關疾病複發突變的發現，這篇論文發表在最新一期《自然》雜誌上，其研究結果有助於從臨床上發現與人類疾病相關的遺傳變異。

人類外顯子組整合資料庫項目提供了一個可公開獲取的參照資料庫，事實已證明這是一個有用的臨床工具，可用於評估潛在的孟德爾遺傳病(單基因病)的致病基因多態，其中一些多態在人口中的普遍程度令人難以置信。論文作者們分析了過往研究所報告的192個此類多態，結果發現，僅9個有充足的數據表明其與疾病相關。

是技術成就 也是政治成就

與此同時，在一篇發表於《醫學遺傳學》雜誌的論文中，英國帝國理工學院羅迪·沃什與同事們評估了一種最常見的嚴重孟德爾病——心肌病的遺傳變異情況。心肌病表現為心肌損害引起心臟擴大，最終發展成心力衰竭，但發病原因一直以來都不是十分清楚。此次研究發現，之前認為與特定心肌病相關的許多基因和基因多態，可能並沒有關係。不過，現在利用ExAC項目已可以顯著改進對基因變體的解讀。

在發表於《自然·遺傳學》雜誌上的另外一篇論文中，美國西奈山伊坎醫學院道格拉斯·魯德夫與同事們也分析了ExAC項目數據集內罕見的拷貝數變異(CNV)。這是一種基因組結構變異，通常由基因組發生重排而導致，是人類疾病的重要致病因素之一，對其展開研究分析，將加深人們對符合孟德爾遺傳規律的單基因病與罕見疾病的了解。

一直以來都有研究設法記錄外顯子組內的遺傳變異，而人類外顯子組整合資料庫是其中規模最大最全面的一個項目。在本期《自然》雜誌伴隨的新聞與觀點文章中，華盛頓大學傑·森德魯總結道，ExAC項目主要針對的是各種常見疾病的遺傳問題，其既是一項技術成就，也是一項政治成就，不僅曾面臨數據爭議，也是研究者、審批許可和14餘項研究之間的角力。

TAG:中國新聞網 |

※美國女子罕見遺傳病酷似外星人 意外成模特界傳奇
※廣醫三院全球首次編輯人類正常胚胎 人類可阻斷遺傳病傳播
※中國境內古人類的第一份基因組分析報告出爐，亞洲人類的遺傳史竟如此複雜
※新疆生地所在西北荒漠建群種遺傳變異分布格局研究方面獲進展
※科學家質疑全基因組關聯研究意義 外圍遺傳突變對疾病影響甚微
※奇異8：遺傳規律無法解釋人類複雜的遺傳病
※中文版《ACMG遺傳變異分類標準與指南》發布
※人體十大最糟糕遺傳特徵
※困擾你的遺傳變異分類終於有標準了！
※因為遺傳病外表醜陋 卻在模特界打出一片新天地
※《ACMG遺傳變異分類標準與指南》中文版正式發布，開啟臨床遺傳諮詢標準化時代
※淺談人類遺傳資源管理變革
※外甥像舅舅有什麼說法 揭開孩子外貌遺傳真相
※揭秘：人類和外星人有共同遺傳規律，難道他們曾於人類進行交配？
※鳴禽辨音，全靠遺傳
※馬天宇全家福暴露其遺傳「女性基因」，嚴肅公開拒絕「狗仔尾隨」
※科學家揭示人類表觀遺傳多樣性模式
※南農張天真組連續發表高質量成果聚焦棉花遺傳與表觀遺傳
※遺傳的不僅是基因！新研究發現表觀遺傳的代傳證據