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「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」

「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」



基因測序技術出現後是不是老的生物分類有很多都被推翻了?

Fillgtaw


測序有風險,分類須謹慎。不管怎麼說吧,如果毫無形態學和古生物學證據的支撐,那麼看起來特別奇葩的分子學結果只能說明:分錯了……但是如果結果對上了呢?那當然是非常激動人心啦!


兩個很經典的例子吧。故事的模式都是一樣的:①「看著像這個,但又有點兒不像」→②「測出來果然不一樣啊!但是未免也太不著邊了吧!」→③「終於測出來對的啦,果然,跟①和②說好的都不一樣呢……」


1。「黏體動物」【它究竟是什麼呢?①原生動物(「孢子蟲」Apicomplexa,現在叫「頂復門」,eg.被青蒿素治得很慘的瘧原蟲和讓寵物貓背了黑鍋的弓形蟲,不再放在動物界中,跟其他各種「奇怪的東西」劃在一起組成「囊泡蟲總門」Alveolata) or ②兩側動物(eg.渦蟲貓咪及其奴隸)or ③刺胞動物(eg.水母)???以下維基之:黏體動物 - Wikiwand】

黏體動物最初被認為是一類原生動物,並被分類在孢子蟲綱中。由於它們在 18S 核糖體 DNA 測序中有獨特的特性,故它們被重置到後生動物。不過後來卻發現了一些矛盾的證據而影響了其分類:雖然18S 核糖體顯示它們接近刺胞動物門,但其他的搜集到的核糖體 DNAHox 基因卻指向與兩側對稱動物相似。後來發現長 2 毫米的 Buddenbrockia plumatellae 原來也是黏體動物,加強了兩側對稱動物分類的說法,因為這種動物的身體構造表面上接近。無論如何,仔細的檢測發現 Buddenbrockia 並非在縱面上兩側對稱,而是四側對稱的,故對此說法仍存有懷疑。進一步的研究搜集了 Cristatella mucedo【一種外肛動物(苔蘚動物),總之跟白斑狗魚一樣是兩側對稱動物】的前三個 Hox 基因及白斑狗魚的第四 Hox 基因,並解釋了黏體動物分類的矛盾。原來最初的實驗是採用了受寄主污染的組織,導致了兩側對稱動物的誤測。後來小心複製了 Buddenbrockia 的 50 個編碼基因,顯示它們是非常進化的刺胞動物門成員,而「水母亞門」(Medusozoa) 是其最近親。【雖然人們早就發現黏體動物的極囊與刺胞動物門的刺細胞有相似的地方,但卻一直被當成是趨同演化的成果。[注意:這句話中文版維基譯錯了……原文去看英文版] 分類學家現已確認放射孢子小群其實只是粘孢子蟲的其中一個生長階段。


圖:維基百科


腦粘體蟲 Myxobolus cerebralis(三角孢子蟲期)【聽說右上角那個就是極囊

「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」


2。「異渦蟲」【①扁形動物門(eg.渦蟲) or ②軟體動物門(eg.海兔、扇貝、章魚) or③後口動物(eg.海參、貓咪及其奴隸) or④比這更奇葩???維基之:Xenoturbella,另外參見有點舊了的中文版】


最開始以為它是一種生物學家們喜聞樂見的新奇的渦蟲啦,而且像個粉襪子一樣……

「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」



然後大家覺得不太對呀,就測了一下,然後,發現它居然是軟體動物門的!結構對不上啊!!!

再研究研究……發現果然,測序樣品里混進了奇怪的東西,因為它是吃軟體動物的卵的……去掉污染再測,結果奇葩了,它就是它,誰也不是。於是妥妥單列一個門:異渦動物Xenoturbellida


那麼問題來了,這個門跟誰比較近呢?答案竟是後口動物!比如:海參,海鞘,文昌魚,武昌魚,貓咪等……


事情到這裡就已經很戲劇化了,但是……


2016 年!新論文說,測序的結果是這個樣子的:1.它跟另一類非常奇葩、以前也曾被當成一類渦蟲的小東西:無腔動物門 Acoelomorpha 聚在一起,比如這個↓Symsagittifera_roscoffensis

「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」



聚在一起(叫 Xenacoelomorpha「異無腔動物」)之後,它們或者是「原口動物」的姊妹群,或者是「原口動物 + 後口動物」的姊妹群。哎!跟說好的又不一樣了!如果真的是原口動物的姊妹群的話還比較好理解,如果真的是「原口動物 + 後口動物」的姊妹群的話那是什麼意思?兩側對稱動物就會變成三分天下了:原口 + 後口 + 異無腔。不過變來變去的也好幾次了,相信這個結果還是會變的,不負責任地猜測一下,應該是深深插進原口裡的一個較早分出的枝吧……


PS:聽說還得解釋一下「原口 vs 後口」?段乎體之:


1.自古,兩側對稱動物(就是現存的除了海綿寶寶及其水母(刺胞動物),和櫛水母這三大門以及絲盤蟲這個小奇葩之外【「中生動物」有爭議,我們按下不表】之外的所有真正的動物)分成了兩大派系


2.一派,把蟹老闆當嘴的那個眼兒當 asshole……


3.另一派,把派大星拿來當 asshole 的那個眼當嘴……


4.我們跟派大星是一夥兒的,


5.因此,我們指著小龍蝦說:「你們是蟲子……」;然後,小龍蝦派出了三體人……海綿寶寶及其水母免於這場無謂的紛爭。


我最不想補充的一個答案:也許出了個大事,現在不想多打字,各位請順鏈接去看吧……


可能是最近一次「滅門」(撤銷整個生物「門」的建制)吧,基因研究推翻了大概在此一年之前的轟動世界的形態學研究。


如果你是個生物學愛好者,那麼這件事你大概會知道:Dendrogramma(「樹狀動物」)被發現,並且研究稱可能是「埃迪卡拉生物群」的最後孑遺,真是嚇死個人啊!!!



wikimedia


的圖,侵刪:)

「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」



當時知道這個消息,我那個激動!但當時我也留了個疑問,這些標本無法進行 DNA 測序(簡單地說,因為泡得太久壞掉了),所以這麼驚天動地的推測全靠形態學研究。因此心裡隱隱留下了一絲擔心。從那以後,我就常常想起這種神奇的「拉撒路物種」,心想著什麼時候新鮮的標本能被再次撈到,被測序研究,解開這個謎團。


時間就這樣過去了。直到昨天,我又想起了這回事,然後,世界又變了,再次徹底變了:


一句話:真的又撈到了


「樹狀動物」,(圖見下,來源鏈接同下「外媒報道」,侵刪)

「終於測出來啦,這物種和說好的果然都不一樣……」



真的測序了,結果真的不是新的門,真的不是埃迪卡拉生物群的孑遺分子,而是一種——管水母——的「苞片」!!!


下面這個鏈接可以下論文哦,自己看吧……


這麼大的事,國內沒有再報道……這就好比說:


地球上發現「三體人」了!!!全球媒體爭相報道,各種嗨皮的評論都有~~~


最後證實:不是「三體人」,而是一種新的人類疾病案例。結果沒人報道……


然後地球上的人類還停留在以為發現了「外星人」的認知與心態之中……


我完全理解,這真的不是造謠,而是科研,科研當然可以出錯了,從形態學出發,搞出個大新聞來,也就是手高手低的事,如果做得太保守了一些,就沒有圈外人士會去關注這些冷門的科研了,不是么?


但是跟進最新科研的報道難道不也是科普所必須的嗎?否則就不是科普了,而是志怪。


我真的不是搞生物的,所以請別說「你怎麼不寫呢!」,我之前真的不知道啊!!!


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