拒絕第三菌：小鼠只和小鼠的菌群專一相愛

今天是第528期日報。

Cell：小鼠腸道免疫要成熟，靠小鼠而非其他動物的菌群

Cell

[IF:30.410]

在無菌小鼠中分別定殖小鼠菌群（MMb）和人類菌群（HMb），兩種小鼠中腸道細菌數量和門水平上的丰度類似，不過細菌物種尤其是厚壁菌門成員各異； HMb小鼠腸道中CD4+和CD8+ T細胞較少，幾乎未見T細胞增殖和樹突狀細胞，抗菌肽表達較低，這些都類似於無菌小鼠身上的特徵； 定殖大鼠菌群也無法促進小鼠腸道T細胞數量增加，而在無菌小鼠和HMb鼠中定殖小鼠分節絲狀菌，則能一定程度重建T細胞數量； MMb鼠則比HMb鼠更能抵抗沙門氏菌的感染。

Gut immune maturation depends on colonization with a host-specific microbiota

2012-06-25 DOI: 10.1016/j.cell.2012.04.037

Cell：小鼠只愛小鼠的細菌，相當專一！

Cell

[IF:30.410]

千萬年來，菌群與宿主共進化，並有助於宿主的代謝平衡，且通過代謝產物、能抵禦病原微生物的保護屏障以及促進免疫系統發育，使宿主免受疾病侵襲； 將小鼠腸道菌群定殖到無菌（GF）小鼠，刺激T細胞的增殖，並有效促進免疫系統發育； 而將人類或大鼠的腸道菌群定植到GF小鼠，其免疫異常，淋巴器官發育不良，淋巴細胞較少，抑菌因子分泌受損； 這表明宿主免疫系統的成熟和性能，取決於宿主特異性的菌群種類，菌群與宿主的共進化很專一。

Host and microbes date exclusively

2012-06-25 DOI: 10.1016/j.cell.2012.06.005

Cell：生命早期的抗生素，傷菌群並長期影響小鼠代謝！

Cell

[IF:30.410]

在小鼠出生後即使用低劑量的盤尼西林（LDP），引起代謝改變並影響迴腸中的免疫相關基因表達； 僅在生命早期使用LDP只是瞬時地擾動了腸道菌群，但足以造成對身體成分的顯著影響，提示嬰兒時期的菌群互作對宿主代謝有著長期的關鍵影響； 另外，LDP增加了高脂飲食誘導的肥胖； 將LDP選擇後的菌群移植給無菌小鼠後，可將促進生長的表型轉移給後者，提示是菌群的改變而非抗生素自身在其中起到了因果作用。

Altering the intestinal microbiota during a critical developmental window has lasting metabolic consequences

2014-08-16 DOI: 10.1016/j.cell.2014.05.052

Cell：人體自身基因，參與塑造腸道菌群

Cell

[IF:30.410]

比較從416對英國雙胞胎獲得的約1000個糞便樣品中的菌群，鑒定出許多分類群的丰度受宿主遺傳因素的影響； 克氏菌科是可遺傳性最高的分類群，與其他可遺傳細菌和產甲烷古細菌形成了共生網路，這些細菌在體重指數較低的個體中更豐富； 將克氏菌移植到小鼠中，小鼠體重增加減緩且腸道菌群組成發生變化； 這些研究結果表明，人類遺傳（人體自身基因）可能通過影響宿主代謝而塑造腸道菌群的組成。

Human genetics shape the gut microbiome

2014-11-24 DOI: 10.1016/j.cell.2014.09.053

Nature：菌群基因丰度越低，飲食干預減肥或越難起效

Nature

[IF:40.137]

基因和環境的複雜相互作用決定肥胖的發生，腸道菌群的組成則或能決定能量獲得效率； 在38名肥胖及11名超重個體中，發現菌群基因丰度下降（40%）的個體表現出更加顯著的代謝紊亂及低程度炎症； 通過幫助降低或維持體重的飲食干預手段，發現這可提高菌群基因丰度，並改善臨床表型； 但對那些原有菌群基因丰度更低的個體，飲食干預似乎不足以改善炎症癥狀； 為此，低菌群基因丰度或可作為飲食干預療效的預測因子。

Dietary intervention impact on gut microbial gene richness

2013-08-29 DOI: 10.1038/nature12480

Science：人體腸道里，大多數菌株或穩定存在數十年

Science

[IF:37.205]

選取37名美國成年人，對受試者在隨訪5年中的糞便菌群組成進行鑒定； 菌群穩定性的變化遵循冪律函數，推測大多數菌株在個體體內可長期存在達數十年； 鑒定出家庭成員之間擁有的共同菌株，但在不相關的個體之間未鑒定出共有菌株； 對連續32周進食單一液體飲食的個體進行採樣分析，提示相比於採樣間隔，通過體重可更好地預測菌株組成的變化； 腸道菌群的穩定性及對生理變化的響應，提示其作為診斷工具及治療靶點的潛能。

The long-term stability of the human gut microbiota

2013-07-05 DOI: 10.1126/science.1237439

Science：菌群參與調控的GPR15，對腸粘膜炎症至關重要

Science

[IF:37.205]

淋巴細胞歸巢在炎症中起著重要作用，在小腸中被廣泛研究，但在炎症性腸病最常見的部位——大腸中很少； GPR15是G蛋白偶聯受體，控制特異性歸巢的T細胞，尤其是FOXP3+ Treg到大腸固有層（LILP）； GPR15的表達由腸道菌群和TGF-β1調控，而非視黃酸； GPR15缺陷小鼠易患嚴重的大腸炎症，可以通過轉移表達足夠多GPR15的Treg可緩解； GPR15是LILP中的T細胞歸巢受體，通過調節Treg的流入在粘膜免疫耐受中起作用。

GPR15-mediated homing controls immune homeostasis in the large intestine mucosa

2013-05-09 DOI: 10.1126/science.1237013

Science：真菌與特定受體互作，影響腸道炎症

Science

[IF:37.205]

哺乳動物的腸道中擁有豐富的真菌群落，通過先天性免疫受體C類凝集素受體（Dectin-1）與宿主免疫系統互作； 缺失Dectin-1的小鼠表現出對化學物誘導結腸炎的易感性增加，是對內生真菌的應答改變的結果； 在人類中，鑒定出Dectin-1（CLEC7A）基因的一個多態性與嚴重性潰瘍性結腸炎顯著相關； 揭示了腸道中的真菌群落與細菌共同存在，且與宿主腸道免疫系統互作，以影響宿主健康及疾病。

Interactions between commensal fungi and the C-type lectin receptor Dectin-1 influence colitis

2012-06-06 DOI: 10.1126/science.1221789

感謝本期日報的創作者：熱心腸先生，桃李不言，沈志勛，小扣啊，女巫

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