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NEJM:全基因組鳥槍法,提高NIPT準確率

NEJM:全基因組鳥槍法,提高NIPT準確率



儘管有報道稱基於孕婦外周血游離DNA的無創產前篩查的特異性超過98%,但報道的21、18、13三體綜合征的陽性預測值卻分別為93%、64%和44%。特異性和陽性預測值之間有明顯的差異,主要是由於這些疾病的患病率較低、檢測技術的局限性以及生物的變異所致,例如雙胎消失或胎盤特異性嵌合體。1月12日,《新英格蘭醫學雜誌》展示了一種新方法可以提高NIPT的準確性。

NEJM:全基因組鳥槍法,提高NIPT準確率



2015年,Snyder及其同事曾在《新英格蘭醫學雜誌》上描述了18三體無創產前篩查假陽性案例,後來被證實假陽性是由孕婦的18號染色體微重複所致。而本次《新英格蘭醫學雜誌》上的新方法也跟識別染色體微重複相關。


研究人員採用全基因組鳥槍法進行無創產前篩查。這種方法能夠產生染色體組型。染色體組型指一個生物體內所有染色體的大小、形狀和數量信息。這種組型技術可用來尋找染色體畸變與特定疾病的關係,比如:染色體數目的異常增加、形狀發生異常變化等。

鑒於Snyder的報道,研究人員對無創產前篩查所得的每個陽性結果進行處理,利用新方法生成並檢查染色體組型。對於真正的陽性結果,增讀序列會延伸至整個染色體;當存在母體染色體微重複時,增加的序列讀取數僅為重複的染色體區域。本研究共涉及了31278名採用無創產前篩查的孕婦,新方法識別出了61例假陽性結果是由母體的13、18、21染色體微重複所致。


在確定染色體組型能準確預測母體染色體微重複之前,研究人員利用微陣列分析的方法證實了疑似微重複的病例,隨後在醫生的斟酌下開展母體微陣列分析。


微陣列分析顯示所有的驗證檢測都存在母體染色體微重複。新方法確定了母體染色體微重複是假陽性的原因,從而使得21、18、13三體篩查的陽性預測值分別提高至98%、92%以及69%。

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21三體綜合征的真陽性結果由羊水細胞染色體核型或微陣列分析方法證實,13和18三體綜合征真陽性結果由特異性超聲異常檢測或羊水細胞分析來證實。這些分析對產前篩查的陰性預測值沒有影響,因為他們沒有發現能代表三體或異常產前超聲診斷的證據。研究人員也未收到產科醫生或者新生兒醫生的不良通知,他們認為這是因為新生兒未出現13或18三體綜合征,因而他們估計陰性預測性為100%。


參考資料:


Improving the Accuracy of Prenatal Screening with DNA Copy-Number Analysis


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