究極異獸吞噬人類後使用其神奇寶貝戰鬥，皮卡丘將使出千萬伏特！

在小智來到阿羅拉地區上學之後，生活變得趨於日常化，但畢竟小智是主角，就算他不去搞事，也總有一些事情會主動找上門來，一開始是骷髏隊和火箭隊的搗亂，之後甚至還有神獸託夢將神秘的小星雲送給了他，後來還進化成了阿羅拉地區的太陽神索爾迦雷歐，現在又趕上通往異次元究極空間的大門被打開，出現的究極異獸將莉莉艾的母親露莎米奈抓走了，小智一行人為了救人再次打開究極之洞的大門，來到了從未見過的世界。

穿越時空後，眾人被眼前的景象驚呆了，這裡的地上寸草不生，幾乎沒有任何生機，只有幾隻究極異獸漂浮在空中，他們為了壯膽叫出了所有的神奇寶貝，全家福的樣子非常像我們童年時的動畫《數碼寶貝》，小智一行人成了被選召的孩子。很快他們就遇到了將露莎米奈抓走的究極異獸虛吾伊德，沒想到才這麼短時間不見，究極異獸虛吾伊德已經和露莎米奈融為了一體，身體和頭髮的顏色都變成了黑色，甚至連思想都被控制了。

更令人沒想到的是融合後的究極異獸還能使用露莎米奈的神奇寶貝，於是焰後蜥被派了出來，為了讓同伴先走，卡奇留在了這裡阻擋這隻神奇寶貝，露莎米奈的身份可是以太基金會的理事長，連私人島嶼都擁有的組織，她的神奇寶貝自然沒有弱小的，就連卡奇也要派出嘎啦嘎啦和噴火龍一起上才能對付。

在其餘人追逐的路上又遇到三隻神奇寶貝，這次只好靠著其他三位同伴來阻攔，而在面對阿勃梭魯的時候，只能由莉莉艾的哥哥格拉吉歐來對抗，讓索爾迦雷歐帶著小智和莉莉艾先行。面對的最後一道難關是與莉莉艾從小陪伴到大，被露莎米奈擅自進化了的皮可西，皮可西面露邪相，很顯然已經變得發狂，認不出來莉莉艾了。

莉莉艾對小智表示她和六尾留在這裡，之前為了幫忙小智將大部分神奇寶貝都派去協助夥伴，於是只剩下小智、皮卡丘和索爾迦雷歐繼續前進了。皮可西向著莉莉艾沖了過來，莉莉艾打心底里知道從小陪她長大的皮可西是不會傷害自己的，於是一邊往前走一邊說起以往的回憶，最終皮可西終於清醒了過來。

以小智和皮卡丘如今的實力可能並不能敵得過融合後的終極異獸，剛剛進化的索爾迦雷歐也不一定能發揮全部的實力，因此這場戰鬥註定會非常艱難，但在下集的標題是「閃耀吧，Ｚ強力手環！超全力的千萬伏特」，預告中皮卡丘戴上了小智的帽子，看來終於要使出傳說中的專屬Z招式「千萬伏特」了！