昆明動物所發現腫瘤鈣信號通路受高甲基化調控
DNA甲基化嚴密調控著基因的表達,在腫瘤發生髮展過程中發揮著重要作用。腫瘤抑制基因啟動子區往往發生DNA高甲基化,而癌基因啟動子區則呈現出低甲基化。因此,異常的DNA甲基化通常被作為腫瘤診斷、分類和治療的重要分子標記。然而,腫瘤是一種高度異質性疾病,尤其是在跨多種腫瘤類型的情況下,腫瘤DNA甲基化對基因表達的調控模式及規律並不十分清楚。
中國科學院昆明動物研究所孔慶鵬課題組通過對TCGA資料庫的12種腫瘤的DNA甲基化狀態及其相應的基因表達模式進行整合分析後發現,多種腫瘤類型的鈣信號通路均發生顯著高甲基化,且發生DNA高甲基化的基因恰好位於鈣信號通路的關鍵節點,例如控制胞內鈣流量的G蛋白偶聯受體、蛋白激酶A等。此外,蛋白互作關係分析發現高甲基化調控的鈣信號通路基因多位於交互網路的中心位置,進一步表明這些基因可能是鈣信號影響腫瘤生物學行為的核心基因。因此,鈣信號通路基因的異常DNA甲基化可能作為腫瘤治療和抗腫瘤藥物開發的一個潛在靶點。
該研究成果發表在Oncotarget上。昆明動物所博士研究生王曉雄為文章的第一作者,研究員孔慶鵬和副研究員何永捍為文章的並列通訊作者。
該項目得到了科技部「973」項目、國家自然科學基金及中科院等研究基金項目的支持。
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