Freenome癌症預警:大數據下的液體活檢技術
癌症起於人,亦止於人。人類與癌症間是一場無法選擇亦永不服輸的戰鬥。
文|崔鳳婷
1000年前,Abulcasis醫生就發明了組織活檢術,醫生可以輕鬆根據組織病灶學結構對病情做出判斷,癌症生存率由此得到提升。技術在不斷應用中成熟,但其弊端也愈見清晰:疼,貴,不準確,不方便,沒醫保。
1000年後的今天,有個年輕帥氣的生物學家在研究時突然「良心發現」:生物學雖發展迅猛,但成果轉化率低的可憐,覺得自己應該做點什麼實在的去助攻這場「人癌之爭」了。於是勾搭了一個臨床醫生,一個免疫療法老總,一個基因組學和一起研究的鬼才,四個人用碼農的思想去解決生物學的問題,致力於實現癌症的無創式提前檢測。
所以今天,講一個碼農時代的生物公司吧。
公司
產品
火視觀點
公司名片
公司名稱:Freenome
創立時間:2015
公司屬地:美國·賓夕法尼亞州·費城
所屬行業:生物醫藥
公司總裁: Gabriel Otte
主要產品:HemoLink
核心技術:基於AGE的液體活檢技術
公司簡介
Freenome成立於2015年,總部在賓夕法尼亞州致力於開發基於AGE的液體活檢技術,深度融合生物測序與計算機技術,採用自身特地設計的學習引擎——適應性基因組學引擎(Adaptive Genomics Engine,AGE)全面整合基因組中關於癌症的信息片段,儘早找出更多癌症細胞的位置,為找到最優的治療方法準備出更多的時間,從而給出儘可能準確的預測,以期真正實現:方便、快捷、價廉、準確、不侵蝕的早期癌症檢測體驗。
公司CEO
Gabriel Otte
Co-founder & CEO
說Freenome是個年輕的團隊一點也不虛,不光團隊組建時間短,團隊成員也都是青年才俊,平均年齡不到28歲,實打實的「小鮮肉天團」。
Gabriel Otte之前在學術界做研究時,意識到生物學發展迅猛,但成果轉化率太低,從這對矛盾中找到商機,找到另外三個夥伴Charlie Roberts、Riley Ennis和Gabriel合夥創立了FREENOME。Charlie 是個臨床醫生,是自由細胞DNA理論的創造者,對無創性提前測試的研究頗深;Riley在免疫療法公司的工作經歷使其對癌症深有研究;Gabriel則為團隊引進了基因組學和儀器的相關知識。四個人的知識融合,計算機科學與生物學融合,便創造除了這個團隊的天馬行空,為癌症無創式提前檢測的實現提供了可能。
商業模式畫布
競爭對手
天下無獨食,液體活檢近幾年的火爆無疑會撩撥一大批公司的心弦,雖然FREENOME來了個開門紅,但不可否認,其他公司也有獲得巨輪融資的。據統計,目前有超過38個公司正在緊鑼密鼓地進軍這個領域。
下面說幾個勁敵吧:
Biocept
專註於CTCs和ctDNA
專業領域:肺癌、結直腸癌、胃癌、乳腺癌和黑色素瘤的診斷與指導治療
液體活檢技術:分析CTCs和ctDNA
優勢:
有自身的技術平台;
ctDNA是癌細胞死亡時產生的DNA碎片,攜帶了大量癌細胞的信息;
ctDNA研究起源較自由細胞早;已開發出靈敏度極高的基因檢測
劣勢:
血液中CTCs含量低,捕獲困難,採集需要大量血液;
目前針對ctDNA活檢公司很多,如Genomic Health,Guardant Health,Personal Genome Diagnostics和Pathway Genomics等,競爭壓力較大。
Codiak BioSciences
體液活檢黑馬
專業領域:胰腺癌的診斷與指導治療
液體活檢技術:胰腺外泌體研究
Codiak利用半年時間實現技術轉化,在成立之初便能夠獲得高達8000萬美元的融資;
基於外泌體的胰腺癌檢測手段特異性和敏感性非常高,可以將慢性胰腺炎與早期或晚期胰腺癌區分開來
外泌體採集不需要大量血液
保存時間長,冷庫保存30年仍可用於分離和檢測
經費非常高,達到甚至超過藥物研發的經費
診斷胰腺癌的蛋白不不受專利保護
公司詳細介紹
Freenome是美國費城的一家新興的液體活檢診斷生物科技公司 ,2014公司成立前,該團隊就憑藉Freenome項目獲得Verizon Powerful Answers獎,獲得獎金鼓勵70萬美元。2016年6月對Freenome來說無疑是個「驚喜爆破點」,在這個月,他們獲得獲得來自Andreessen Horowitz等五家公司的555萬美元的風投,也是該公司的首輪公開投資。
有了Andreessen Horowitz提供了強大的資金支持,Freenome還同加利福尼亞大學聖迭戈分校等研究所只有建立了合作關係,目前,該公司已和多家研究機構建立合作關係,主要用來驗證AGE的新型,並將其整合到大資料庫中,機構提供盲材料,AGE對其進行分析,從而確定產品的靈敏性。
通過訓練不斷調整系統的靈敏性,從而從創建一種「泛癌症」檢測,進而給病人提供臨床及診斷與治療方案,Freenome用實力證明了自己的價值。作為一家新興的液體活檢診斷生物科技公司,Freenome無疑是幸運的,但是,種下一顆種子,坐等大樹養成,對於它的金主來說,不也是同樣幸運嗎?
產品與技術
AGE學習引擎工作模式
(采血-大數據分析-結果)
FREENOME除卻擁有普通液體活檢技術的優點,即成本低、易操作、避免了傳統活檢侵入人體所造成的的疼痛。獨特之處在於巧妙地運用了計算機強大的計算能力,憑藉團隊紮實出色的專業知識,完美結合了生物相容性,生物物理,細胞和大數據四個方面的專業知識,設計出一套專門針對FREENOME(即自由細胞,與該公司同名,是身體一萬個細胞中血液中的遺傳物質流的集合,伴隨著人生老病死,是身體活細胞基因組在時間和空間上的變化)的計算方法,並由此開發出有效的學習引擎(AGE)進行數據分析。不僅可以進行基因組測序,還可以利用採集人體血液中的自由細胞進行大數據分析,更好地了解一個人的癌症早期的信號,從而給出臨床級診斷和治療建議。相對只專註幾個少數突變的液體診斷,AGE將關注更多的突變先兆,從而給出更為準確突變信息,其中包括突變的位置,達到更為精準的診斷結果。
不得不說的是,AGE還可以檢測到自身存儲的知識,將大資料庫不斷充實,這也就意味著:隨著時間推移,你做檢測的次數越多,得到的診斷信息也就更為準確。
這種方法不僅可以幫助用戶提前了解身體的健康狀況,任何癌症早期的異常信號都不會逃出它的法網。從而能夠做到早監測,早治療,進一步改善癌症患者的治療現狀,創造出個性化、非侵入的疾病診斷及正常的健康診斷。
A16Z的新晉普通合伙人Vijay Pande表示:「機器學習的問題在於訓練機器需要大量數據,而醫學可以生成大量數據(從放射學到基因學),就這一點而言,兩者的合作有得天獨厚的優勢」
Pande同樣認為:「Freenome所處的液體活檢領域和團隊擁有的技術背景完全符合我們投資的理念,通過兩者的結合,我們能夠更早的找到更多癌症細胞的位置,從而找出最好的治療方法。」
Freenome公司的創始人兼CEO奧特:「生物學家和碼農在面對同一個問題的時候,思考邏輯是完全不一樣的。生物學家會先找到出現問題的地方,然後對症下藥。而碼農會從更加數據化的角度去思考問題,分析更大量級的數據。」
AndreessenHorowitz投資人VijayPande表示:「治療癌症不能等待有新的藥物,只能通過發現癌症然後用已有的癌症藥物來治療。而80%的癌症都可以通過提前發現得到治癒。而Freenome的產品正解決了提前發現癌症信息的問題。」
寫在最後
生物學家和碼農
看似兩個物種
但有一個終點要抵達
只不過
一個拖住死神的尾巴
一個加快人類的步伐
說相關,也無關
只有一個結論:
有容,世界和平
※癌症患者需要自信:當「口紅天使」降臨癌症病房
※燒烤影響癌症倖存者的死亡風險
※阿斯利康推出用於癌症藥物研發的機器人
※誰也沒想到,睡前肚臍上敷這一物,癌症統統靠邊站
※比癌症更可怕的郁證,看老中醫如何藥到病除!
TAG:癌症 |
※Palmer Luckey公司測試軍用頭顯數據傳輸技術
※Google Search Console開始提供關於Web Light呈現搜索結果的數據
※Android端運行Tensorflow的demo去分類自己的數據集
※富士通展示Dataffinic Computing高速大數據處理原型技術
※Google、Facebook、微軟和Twitter聯合推出數據轉移項目,希望替代傳統API
※Windows免費的數據恢復軟體
※大數據科普:神經網路入門-監督學習 Supervised Learning
※全球3大軟體公司Microsoft、SAP和Adobe宣布開放數據計劃 Salesforce你怎麼看?
※大數據競爭對手Cloudera和Hortonworks宣布合併
※Guess.js:Google的數據驅動改進前端體驗的工具庫
※redis-cli pipe方式導入mysql sql查詢導出redisProtocol格式數據
※linux-shell命令處理json數據
※talmo-design-cables數據線品牌與包裝設計
※solr 數據導入中unable to read:dataimport.properties的解決
※使用mobilenet訓練自己的數據
※Telegram發布Telegram Passport,對ICO等數據進行加密
※App Store精選軟體:SYS Pro-系統數據實時監測工具
※python機器學習庫sklearn——生成樣本數據
※大數據存儲系統對比:Ceph VS Gluster
※如何在本地數據中心安裝Service Fabric for Windows集群