Leukemia：鑒定出與34種AML白血病亞群相關聯的基因突變

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針對成年急性髓細胞白血病（acute myeloid leukemia, AML）患者的一項新的大型研究將80種癌症相關基因突變與5種AML亞型相關聯，這5種AML亞型可通過特異性的染色體異常加以確定。在未來，這些發現可能有助指導基因突變測試和治療決策。

在來自美國俄亥俄州立大學綜合癌症中心阿瑟-詹姆斯癌症醫院和理查德-斯洛夫研究所的研究人員的領導下，這項研究包括1603名新確診的成年AML患者，這些患者在美國多個中心開展的癌症與白血病B組/腫瘤學臨床試驗聯盟（Cancer and Leukemia Group B/Alliance for Clinical Trials in Oncology）臨床試驗中接受治療。

這些研究人員將確定著34種AML亞群的細胞遺傳學異常與80種癌症相關基因的突變狀態相結合在一起，產生一種「腫瘤印記（oncoprint）」，即針對與每種AML亞群相關的基因突變進行簡明的表格總結。

正如在Leukemia期刊上報道的那樣，這項研究鑒定出：

（1）這34種AML亞群之間的潛在重要的遺傳差異；

（2）這些AML亞群與特異性的基因突變和功能基因組之間存在的意想不到的關聯；

（3）小於60歲、60歲及以上的AML患者在細胞遺傳學特徵和突變特徵方面存在的顯著差異。

論文共同第一作者、俄亥俄州立大學/醫師-科學家培訓計劃成員Ann-Kathrin Eisfeld博士說，「我們的研究在一張圖片中總結了1603名AML成年患者的細胞遺傳學信息和突變信息。鑒定出每種AML亞群的關鍵突變特徵可能有助我們更好地理解不同的AML亞型的發病機理，並且為正在進行的和未來的研究提供大量信息。」

論文共同通信作者、俄亥俄州立大學知名教授Clara D. Bloomfield博士補充道，「如果我們的發現得到證實，那麼這可能意味著我們的突變腫瘤印記可能有助指導突變測試和潛在地在未來為AML患者作出治療決策。」

就這項研究而言，Eisfeld、Bloomfield和他們的同事們獲得來自每名AML成年患者的預處理骨髓或外周血樣品。在這些患者當中，1080人在60歲以下，523人在60歲或以上。所有的這些患者在癌症與白血病B組（Cancer and Leukemia Group B）臨床試驗中接受相類似的治療。

根據每名患者的白血病細胞是否存在特異性的染色體異常，他或她經確診後可歸為5種AML亞型中的一種和34種AML亞群中的一種。沒有染色體異常的AML患者被分類為患有細胞遺傳學正常的AML（cytogenetically normal AML, CN-AML）。

這些患者的白血病細胞接受測序以便了解80種癌症/白血病相關基因的突變狀態。基於這些基因的生物學功能，這些突變被分配給9種類型（比如，甲基化相關的，黏連蛋白複合體，染色質重塑，腫瘤抑制基因）。

這些研究人員在這些患者中鑒定出4390種基因突變，平均每名患者發生3種突變。總體而言，在這些患者當中，導致AML產生的最常見突變基因屬於甲基化類型。

這種突變腫瘤印記的關鍵遺傳差異包括：

（1）CN-AML患者、複雜核型AML患者或非平衡染色體異常的AML患者的甲基化相關基因存在較高的突變發生率；

（2）相比之下，甲基化相關基因的突變在CBF-AML患者體內幾乎是缺乏的，或者在非CBF-AML相關平衡易位或倒置的患者體內是更加罕見的；

（3）剪接體基因突變在非平衡染色體異常的患者體內是比較常見的，特別是在那些染色體4三體綜合征患者、染色體8三體綜合征患者、染色體11三體綜合征患者、染色體13三體綜合征患者或染色體21三體綜合征患者患者。

原始出處：A-K Eisfeld, K Mrózek, J Kohlschmidt et al. The mutational oncoprint of recurrent cytogenetic abnormalities in adult patients with de novo acute myeloid leukemia. Leukemia, Accepted article preview online 21 March 2017, doi:10.1038/leu.2017.86