基因組分析顯示:卵巢癌有7種疾病亞群
一項新研究表明,基因組分析可為卵巢癌提供新的治療信息。由BC癌症研究所和哥倫比亞大學引領的一項國際研究追蹤了100多個卵巢癌的點突變和結構變異,經過分析,確定了7種腫瘤分子亞型。相關研究結果於4月25日在線發表在《Nature Genetics》雜誌上。
本文作者寫道,「我們的研究結果表明,識別卵巢癌組織類型,體細胞基因組中的點突變和結構變異是強大且具有判別性質的生物標誌物。」
在本次研究中,研究人員主要分析了133例卵巢癌。其中59例為高級別漿液性卵巢癌,35例為卵巢透明細胞癌,29例為子宮內膜癌,10例為成人型卵巢顆粒細胞瘤。研究人員對這些患者進行基因組測序,將腫瘤樣本和正常樣本進行匹配。
除了通過擴增子測序來驗證潛在的結構變異,該研究團隊還剖析了BRCA1/2胚系突變、BRCA1基因啟動子甲基化狀態以及腫瘤的微衛星不穩定模式。此外,他們還把臨床可用數據納入到分析中。
研究人員結合了點突變、拷貝數、微小插入和缺失、結構變異等20個基因組特徵,最終將這些病例分成了7個亞群,其中至少一種亞群對卵巢癌的預後提供了線索,這種亞群是高級別漿液性卵巢癌的一種類型,標誌性的特徵為鹼基折返倒置(foldback inversions)。
研究人員報道稱,大約40%的高級別漿液性卵巢癌出現折返倒置,這往往與無進展生存期以及鉑類化療後總生存期較差有關,尤其是當腫瘤出現較高水平的鹼基倒置時。其餘的高級別漿液性卵巢腫瘤往往表現出同源重組缺陷的跡象,通常擁有更好的結果。
隨後他們對來自國際癌症基因組協會和腫瘤基因圖譜計劃中的600例卵巢癌數據進行了分析,結果與上述研究相一致。他們還確定了卵巢透明細胞癌的亞群,標誌特徵為與年齡相關的突變。另外,他們還在子宮內膜瘤亞型中看到了微衛星不穩定性和相關的突變。
作者指出,總體而言,這項研究結果提供了一種新的卵巢癌疾病分型方式,確定了新的生物分子分型,給未來治療提供了新的機會。
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