生物庫干血點中蛋白質的穩定性
生物樣本庫BS小組
摘要:
生物樣本庫建設的一個重要目標就是發現生物標誌物,以在疾病早期可治癒階段達到確診目的。這需要樣本庫不斷的從大量個體中有效採樣,並且在保護潛在生物標誌物的條件下收集並存儲樣本。因為干血樣本收集和儲存的便利性和低成本,干血樣本對生物樣本庫存儲非常有利。在本文中我們使用多重PEA實驗(proximity extensionassays)分析分別在4°C或-24°C溫度下存儲長達30年的干血紙片上干血斑中與腫瘤學相關的92種蛋白質,以研究干血片這種保存方式對蛋白質檢測的適用性。
我們的主要發現是:1)乾燥僅輕微影響血液蛋白檢測的措施(平均相關性為0.970),並且檢測結果可重複(相關性為0.999),2)一些蛋白質含量在整三十年內沒有顯著影響(這些蛋白質分別佔在4℃和-24℃溫度下被分析蛋白質的34%和76%),而其他蛋白質水平以10-50年為半衰期的速度緩慢降低,3)干血片上的蛋白質分別在4°C或-24°C儲存10年後,其丰度平均值分別降低為起始濃度的80%和93%,由此,與4℃相比,干血樣本儲存在-24℃時蛋白質的可檢測性受影響較小。我們的研究結果令人鼓舞,實驗結果提示干血片是生物樣本庫收集大量血液樣本更為經濟的方式;即使對於捐獻者自己,運送和存儲樣本也更為經濟。我們可以結合新興手段測量干血樣本中數百或數千種蛋白質,並作為血液生物標誌物常規分析方法,這樣生物樣本庫可以在發現生物標誌物中發揮更大的醫學價值。
編者按:因為干血樣本的收集和儲存非常便利性,且成本較低,干血樣本是生物樣本庫存儲的可選擇方式之一。本文中通過對不同保存條件下長期保存的干血樣本中一些蛋白質進行檢測,研究結果令人鼓舞,-24℃保存30年的干血樣本中76%蛋白質含量沒有顯著影響。研究結果提示干血片是生物樣本庫收集大量血液樣本較為經濟的方式;且可結合新興手段進行更多蛋白類生物標誌物,發揮生物樣本庫更大的醫學價值。
作者:Bj?rkesten J, et al.【Uppsala University, Sweden】
編譯:趙雪梅【上海交通大學附屬瑞金醫院】
校審:王雅傑【首都醫科大學附屬北京天壇醫院】
原文:【17083】
Stability of Proteins in Dried Blood Spot Biobanks.Mol Cell Proteomics. 2017May 13. pii: mcp.000015.2017. doi: 10.1074/mcp.RA117.000015. [Epub ahead ofprint]
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