南農張天真組連續發表高質量成果聚焦棉花遺傳與表觀遺傳

6月5日，來自南京農業大學作物遺傳與種質創新國家重點實驗室張天真教授（2016年3月起任浙江大學農生學院教授）團隊與中國農科院棉花研究所杜雄明研究員合作在Nature Genetics雜誌上在線發表了題為「Genomic analyses in cotton identify signatures of selection and loci associated with fiber quality and yield traits」的研究性文章。該項研究通過對318份棉花的全基因組重測序，揭示了從美棉品種改良為全球最大纖維作物的遺傳基礎和演化規律，鑒定出25個品種改良相關位點和119個產量、纖維品質、黃萎病抗性等關聯位點，尤其是鑒定出能同時提高2-3個產量性狀或纖維品質性狀的關聯基因，為棉花「精準育種」提供了優異的基因資源和理論指導，有非常重要的利用價值。

5月31號，張天真教授課題組與德克薩斯大學Z. Jeffrey Chen的課題組合作，在Genome Biology雜誌上發表了題為「Epigenomic and functional analyses reveal roles of epialleles in the loss of photoperiod sensitivity during domestication of allotetraploid cottons」的研究論文，通過將美國陸地棉與野生棉對比，首次繪製出棉花表觀遺傳基因的「甲基化基因圖譜」，分析了野生棉和種植棉之間500多種表觀遺傳基因的差異，為幫助研究人員選育出擁有某些新特徵的新品種，提高棉花的產量，改善其抗旱性、耐熱性或抗蟲性提供了重要參考線索。

今年2月20日，張天真教授研究組與中科院上海植生所黃學輝研究員（現任上海師範大學教授）合作也是在Genome Biology雜誌上發表了題為「Genomic insights into divergence and dual domestication of cultivated allotetraploid cottons」的研究論文，發現從多年生灌木到一年生棉花的起源和馴化規律。

張天真教授課題組主要致力於將棉花基因組研究的理論與技術用於新材料創製和新品種培育與利用研究，近年來在高水平雜誌上發表了一些列重要成果。除了上述三項今年發表的成果之外，比較有代表性的研究包括2015年4月20日由張天真教授和陳增建教授牽頭聯合德克薩斯大學Z. Jeffrey Chen的課題組組成的一個國際合作團隊共同完成了陸地棉基因組的測序。相關研究成果以「Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fibre improvement」為題發表在Nature Biotechnology雜誌上。

2015年5月24日，繼4月20日在Nature Biotechnology雜誌上發表陸地棉基因組的測序結果之後，張天真團隊在Genome Biology雜誌上又發表了題為「Sequence-based ultra-dense genetic and physical maps reveal structural variations of allopolyploid cotton genomes」論文，該成果利用二代高通量測序技術和有效的SNP基因型分型方法，構建了四倍體棉花4,999,048SNPs位點的超高密度遺傳圖譜。

說明：以上信息主要來源於南京農業大學官網的相關報道。

附張天真教授簡介：

張天真教授本科畢業於浙江農業大學，碩士學位和博士學位都是在南京農業大學獲得的，1986年開始在南農任助教，隨後逐步晉陞為講師、副教授和教授，期間還在德國魯爾大學做過一年的博後。2016年3月起擔任浙江大學農生學院教授。此外，他還擔任國際棉花基因組計劃(ICGI) 協調委員會委員兼結構基因組研究工作組主席 、中國棉花學會副理事長等職務。張天真教授致力於將棉花基因組研究的理論與技術用於新材料創製和新品種培育與利用研究。近10年育成南農早(2002年國審)、南抗3號(2001年蘇審、2005年國審)、南農6號(2005年國審)、南農10號(2008年國審)等棉花新品種12個, 南農系列品種累計推廣3000 多萬畝，產生了顯著的經濟和社會效益，同時也推動了棉花種業的迅速發展。其中，轉基因抗蟲雜交棉「南抗3號」的推廣利用是長江流域棉區以國產抗蟲雜交棉取代美國抗蟲棉的3個主要品種之一。

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