微生物群落多樣性研究也可以變得如此簡單

微生物群落多樣性分析是以研究環境中微生物的種類和數量為目的，揭示隨環境變化導致微生物群落結構變化的過程。

在國內，微生物多樣性的研究涉及農業、土壤、林業、海洋、礦井、人體醫學等諸多領域。

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什麼是擴增子測序？

擴增子測序是研究微生物多樣性的重要手段之一。雖比較基礎，方法簡單，但在微生物多樣性的研究中仍佔據一席之地。

優點：

價格便宜，僅通過相對簡單的測序手段即可獲得較理想的結果。

不斷更新的生物信息學分析技術，可以更多挖掘 16S 數據中的群落功能信息，分析更為全面。

16S 測序能在微生物多組學研究中起到基礎的群落篩選作用，從而保證為貫穿研究提供準確的多樣性信息補充。

擴增子測序利用保守區設計通用引物進行 PCR 擴增，再對高變區進行測序分析和菌種鑒定。是研究環境樣本中微生物群落結構組成、挖掘樣品間差異的重要手段。

可分四類：

16S rDNA 測序（一般細菌：V3-V4 區）

18S rDNA 測序（真核微生物）

ITS 測序（真菌）

功能基因區域測序（固氮菌、反硝化菌等特定長度的 PCR 產物測序）

如何進行微生物群落多樣性研究的實驗設計？

晶能生物用戶實例：通過 16s rDNA 進行 V3 - V4 區 Miseq 測序，重點關注潛流人工濕地的微生物群落結構，以及在低溫環境下，耐寒植物對該類型濕地脫氮效率及相關微生物群落的影響。下面通過此研究實例來總結微生物群落多樣性的實驗設計。

研究思路/實驗設計總結

晶能生物最新推出微生物多樣性測序團購促銷活動，活動詳情如下：

促銷活動

活動詳情：

樣本量≥100 個：7 折

樣本量≥200 個：6 折

樣本量≥300 個：5 折

活動時間：即日起至 2017.9.1

測序平台：Illumina Miseq

標準分析內容：

OTU 聚類和物種注釋-α多樣性分析、β多樣性分析

物種分類-物種組成分析、差異分析、分組評估

樣本要求（DNA 樣本）：

樣品濃度：≥50 ng/ul

總量：1 μg/sample

純度：OD 260/280 在 1.8～2.0

樣品質量：基因組完整、無降解、無污染

樣品包裝：用封口膜密封樣品，DNA 低溫運輸（-20℃）

文章來源：晶能生物

圖片來源：晶能生物

圖片來源：視覺中國

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