Nature子刊揭曉長壽人群中的神秘基因
基因遺傳分離群體(genetically population isolates)在基因組測序和鑒定中的應用不僅限於罕見疾病的研究; 這些分離人群也為深入理解常見疾病的生物學基礎及其組成特徵提供了有用資源。良好的人類群體為眾多遺傳研究提供了優秀的研究樣本,涉及面跨越全基因組關聯研究(GWAS)到探索基因與環境之間的相互作用。
近日,正是利用基因遺傳分離群體研究的優勢,來自英國Wellcome Trust Sanger Institute研究所的科學家們發現了解決一個遺傳學難題的關鍵性線索:與其他地區的人口相比較,為什麼希臘境內一個孤立的群體能夠過著相對更加健康的生活?他們的研究發現,一種已知可有效保護心臟健康的基因遺傳變異體在這個希臘小型人口群體中比其他歐洲人群高40倍。這一重要創新發現以論文形式發表在了最近一期的《自然》子刊《Nature Communications》上。
希臘Anogia和周圍的Mylopotamos村莊的居民生活在克里特島(Crete)的山區裡面。在整個希臘國內,這些居民聞名於其長壽並且健康的生活風俗,儘管他們的飲食習慣中包含豐富的動物脂肪,但卻並沒有因此而導致危及健康的相關併發症。
為了解決這個難題,英國Wellcome Trust Sanger研究所、Anogia醫學中心(Anogia Medical Centre)和哈羅科皮奧大學(Harokopio University)的合作團隊,從Anogia及其Mylopotamos周圍的村莊中獲得了1200多人的生物學遺傳物質樣本。然後,他們使用DNA微晶元技術(Illumina HumanExome Beadchip)來更全面地調查具有可能改變破壞蛋白質功能的相對稀有變體的基因組區域,特別是尋找與脂質性狀相關的功能性編碼變體。
他們發現,基因APOC3中的遺傳變體R19X在這個人群中比在其他歐洲地區人群中更常見。該變體功能性地降低增加心臟病風險的血脂甘油三酯(triglyceride)水平,並且它增高了高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)的水平。HDL也稱為「好膽固醇」,可降低心臟病的風險。在其他歐洲人群中,這種R19X變體存在於0.05%的人群中。但在被研究的這批人群中,人口百分比高達2%。這一心臟保護性遺傳變異體R19X,首次於2008年在阿米什(Amish)人群中被觀察到。這項研究表明,R19X變異體不僅僅局限於阿米什人社區之中。
本文聯合第一作者、Wellcome Trust Sanger研究所的Lorraine Southam博士說道:「通過研究孤立人群,我們能夠識別與世界其他地區人口相比頻率更高的遺傳變體。這樣可以反過來檢測這些變異是否是導致疾病的主要原因。針對孤立的群體,我們可以獲得獨特見解,理解在複雜人類疾病中發揮重要作用的罕見遺傳變異體。」
該論文通訊作者、Wellcome Trust Sanger研究所的Eleftheria Zeggini教授說道:「Mylopotamos村的居民與希臘一般人口的糖尿病患病率相同,但不患有疾病併發症,這樣的遺傳學研究可以幫助我們開始理解為什麼會有這樣的神奇現象,」她還說道:「這項研究顯示了觀察整個基因組以更好地了解群體遺傳結構的重要性。我們已發現與心血管疾病性狀相關的醫學上的遺傳變異。心血管疾病是全世界最常見的死亡原因。」
來源:葯明康德
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