鱷魚的祖先可能也具有一定的熱調節能力

鱷魚

骨組織學研究是討論脊椎動物溫度調節機制的一個重要方法。曾經，恐龍的恆溫骨組織學研究是基於外溫動物與內溫動物間骨組織學與生長速度以及基礎代謝率存在相關性。如果一種動物生長方式類似現代爬行動物，緩慢生長，就被認為是冷血動物；如果迅速生長，類似哺乳類及鳥類，就認為可能是溫血動物。Bakker採納的骨組織學證據被後來研究者認為是無效的。因為骨骼的高度血管化廣泛分布在內溫與外溫動物中，哈氏管與熱調節無關，而且纖維層狀骨與高代謝可能無關。各類恐龍骨組織學特徵差別很大，不能把全部恐龍同等看待。

如有些恐龍在密質骨的外緣可見休眠線，而有的沒有。這說明有些恐龍是有限定的生長，有的恐龍則是終生生長。基於很多恐龍中存在的生長環，Chinsamy等人認為恐龍的代謝率介於爬行類與鳥類和哺乳類之間，熱血的基本形式在鳥類的進化歷史中出現得比較晚，並不是從它們的恐龍祖先那裡繼承下來的。而de Ricqles和Padian等認為低的生長速度並不能說明問題，恐龍，至少是獸腳類恐龍還是內溫動物。他們的研究還推測翼龍有高的生長速度、高的代謝水平，有晚成雛，及育兒時間較長；也可能是內溫動物。最近基於心臟的研究表明鱷魚的祖先可能也具有一定的熱調節能力，這樣的話，鳥類的內溫在基幹主龍型類就已經初步具備了。

生物成因的磷灰石中氧同位素比率（δ18Op）很早就被用於重建古氣候，但是在上世紀90年代研究者開始注意到其組成與脊椎動物體溫有關，可以用於推測動物的代謝情況。起初有人根據骨骼中較均一的氧同位素比值推測恐龍是恆溫的，但是有人質疑化石未能夠保存原始的同位素比值。另外一種方法是比較恐龍與外溫動物的氧同位素比率。假設共存的動物攝入的水的成分一致，但是氧同位素分餾與體溫有關，所以磷灰石中氧同位素比率應該不同。在全球範圍內生物體內的氧同位素比率主要取決於攝入的水，而水主要來源是雨水。雨水中氧同位素比率隨緯度升高和氣溫下降而減小，故隨緯度升高外溫內溫動物δ18Op值均減小。因為磷酸鹽與水氧分餾隨溫度降低而增大，所以在大於緯度50°處，外溫動物的δ18Op值比內溫的高，而在低緯度外溫動物的δ18Op值比內溫的低。用這種方法對晚白堊世四類恐龍研究表明當時它們都具有高而恆定的體溫，推測都是內溫動物。這也是很間接的手段，無法得出直接的體溫。

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