Cell刷新認知:幾乎任何基因都可以影響疾病
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研究人員發現,細胞內各基因間相互關聯,幾乎任何基因都可以影響疾病。 因此,大多數疾病的遺傳特性不能歸因於少數的核心基因,而是來自眾多在疾病途徑之外起作用的外周基因的微小貢獻。
這項工作在6月15日Cell發表的一篇論文中有所描述。 遺傳與生物學教授Jonathan Pritchard博士是論文的資深作者。
研究人員將其對疾病基因的新認識稱為「全能模型」,以表明幾乎任何基因都可以影響疾病和其他複雜性狀。「在任何細胞中,可能有50到100個對特定性狀有直接作用的核心基因,在同一細胞中也會表達另外10,000個外周基因,這些外周基因對該性狀具有間接影響。」Pritchard說,Pritchard是休斯醫學研究所的調查員。
每個外周基因對性狀影響很小。 但是,由於這些成千上萬的外周基因數量超過核心基因數量,與疾病和其他性狀相關的遺傳變異大多數來自外周基因。 因此,諷刺的是,對疾病有間接影響的基因,最終決定了該疾病的遺傳模式。
紐約基因組中心的研究員Joe Pickrell博士說:「這是一篇令人信服的論文,提供了一個合理模式來解釋基因組疾病領域中的一些令人困惑的現象。」
多基因模型到全基因模型的跨越
Pritchard指出:他一直認為複雜性狀符合多基因模型,其中每個基因對性狀都有直接影響,無論這種性狀是身高還是疾病,如自閉症。
去年,Pritchard在彙編一篇關於北歐人身高演變的論文時,他重新開始思考這個觀點。
在早期研究身高遺傳性狀時,Pritchard和他的同事驚奇地發現,基本上整個基因組都會影響身高。他說:「說實話,我以為這可能是錯的。」之後, 他的團隊花了很長時間試圖了解這令人驚訝的結果。
相反,他說:「我逐漸意識到數據並不適合多基因模型。我們開始思考,如果整個基因組參與像身高這樣的複雜性狀,那麼是如何參與的呢?「
治療意義
多基因模型指引研究人員將重點放在已知的影響疾病的核心基因上。 因此,治療研究通常意味著解決這些核心基因。 文章指出,發現基因的常規方法是做更大的基因組關聯研究,但Pritchard的團隊反對這種方法。
相反,他建議進行核心基因的深度測序,以尋找可能具有更大影響的罕見突變體。 對於臨床使用,Pritchard說,利用基因組關聯研究可以預測個體患者基於外周基因的危險因素,以設計個性化藥物。
對基礎科學的啟示
Pritchard的全能模型為生物學發展提供了新方向,意味著生物學家需要更多地思考將數千種外周疾病基因連接在一起的網路結構。
參考文獻:Evan A. Boyle, Yang I. Li, Jonathan K. Pritchard. An Expanded View of Complex Traits: From Polygenic to Omnigenic. Cell, 2017; 169 (7): 1177 DOI:10.1016/j.cell.2017.05.038
End
近期,由上海市遺傳學會、上海市遺傳學會遺傳與分子診斷專業委員會、上海市醫學會分子診斷分會主辦的「2017浦江遺傳與分子診斷產學研論壇」於2017年6月26日在滬屆時舉辦。本次論壇中,由同濟大學附屬東方醫院南院檢驗科主任 吳文娟教授帶來《感染病精準檢驗》的報告。金力院士也將親臨會場帶來《中國精準醫療計劃解讀》的報告。另外,該論壇為國家級醫學繼續教育I類項目,與會代表可獲得I類學分4分。
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