來自古埃及木乃伊的首個基因組數據
由德國圖賓根大學和耶拿馬克思·普朗克人類歷史科學研究所的科學家主導的國際團隊成功從約公元前1400年到公元400年的埃及木乃伊中,恢復並分析了古代人的DNA,包括首個三人全基因組細胞核數據,建立了古代埃及木乃伊作為研究古代歷史的可靠遺傳材料源的地位。這一研究已發表在自然通訊雜誌上,發現現代埃及人的血統更偏向於撒哈拉以南非洲而不是古埃及人,而古埃及人與近東的古代人最為相關。
對於古人類研究而言埃及是個不錯的地方,有豐富和記錄良好的歷史,並且地理位置和與周圍亞歐非人群的交流使其成為一個動態區域。近期在古代DNA研究方面的進展提供了利用古代基因數據測試現有埃及歷史理解的有趣方式。
然而,由於方法和污染問題,古埃及木乃伊的基因研究非常少見。雖然某些首個古代DNA就是從木乃伊殘骸中提取出來的,科學家仍質疑那些基因數據,特別是來自木乃伊的細胞核基因組數據的可靠性。馬克思·普朗克研究所主任Johannes Krause確認道:「對於可能保存的DNA應該持懷疑態度。埃及的高溫氣候、很多陵墓中較高的濕度以及木乃伊製作技術中使用的某些化學品都會導致DNA降解,使得埃及木乃伊中的DNA不太可能長期存在。」該研究的作者從這種木乃伊中提取了細胞核DNA,並利用魯棒認證方法證實了其可靠性,是一個重要突破,為進一步直接研究木乃伊殘骸打開了大門。
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該研究中,圖賓根大學、馬克思·普朗克人類歷史科學研究所、劍橋大學、波蘭科學院以及柏林人類學、人種學與史前協會的研究者對1300多年跨度內的遺傳差異和種群連續性進行了研究,並與現代人類進行了比較。研究團隊從Abusir el-Meleq考古遺址等地收集了151個木乃伊樣本。
研究者總共從90個木乃伊中恢復了線粒體基因組,恢復了三個木乃伊的全基因組數據集。利用這些收集的數據,研究者能測試先前從考古、歷史數據以及現代DNA研究中得出的假設。圖賓根大學研究者Alexander Peltzer解釋道:「我們對Abusir el-Meleq古代棲息地基因組成的變化和連續性尤為感興趣。」該團隊想確定所調查的古人類群體是否受到了研究的歷史時間段內外來征戰者和統治者基因水平的影響,並將這些群體與現代埃及相當群體進行比較。小組領導Verena Schuenemann 解釋道:「我們想測試亞歷山大大帝和其他外來統治者的征服是否在古埃及人群中留下了遺傳印記。」
古埃及人和近東古代人類之間密切的基因聯繫
該研究發現古埃及人與累范特的古代人類關係最為緊密,並且與安納托利亞半島和歐洲的新石器時代人類關係也較為密切。馬克思1普朗克研究所小組領導Wolfgang Haak說道:「Abusir el-Meleq群體的基因在我們所研究的1300多年裡沒有多少重大變化,表明這一人群的基因相對沒有受到外來征服和統治者的影響。」數據顯示現代埃及人細胞核層面血統中的撒哈拉以南非洲人遺傳成分比古代埃及人的多了8%。馬克思·普朗克研究所小組領導Stephan Schiffels解釋道:「這表明在過去1500年里撒哈拉以南非洲流入埃及的基因增多了。」可能的起因因素包括尼羅河更頻繁地變道、撒哈拉以南非洲和埃及之間的遠距離貿易增多以及1300多年前開始的橫穿撒哈拉奴隸貿易。
該研究反擊了對從埃及木乃伊中恢復可靠古代DNA的可能性的先驗懷疑論。雖然有氣候和木乃伊化方法帶來的種種潛在降解和污染問題,作者還是利用高通量DNA測序和魯棒認證方法確保了數據的古代來源和可靠性。該研究因此也證實埃及木乃伊可以是古代DNA的可靠來源,能很好地得到準確和精細的埃及人類歷史理解。
論文原文:doi:10.1038/ncomms15694
本文譯自 phys,由譯者 CliffBao 基於創作共用協議(BY-NC)發布。
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