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知道通路中的相關靶點,要怎麼來驗證呢?

今天和大家分享的是2017年6月發表在Science Translational Medicine上的一篇文獻。該文獻標題為「Targeting KRAS-dependent tumors with AZD4785, a high-affinity therapeutic antisense oligonucleotide inhibitor of KRAS」(回復170712可下載文獻,一周有效)。

一、科學假說

早在1982年,就有研究發現了KRAS是一個重要的原癌基因。KRAS是RAS GTP酶家族的一種的同工酶,主要催化GTP和GDP之間的轉化,從而影響細胞內外信號轉導。

KRAS基因具有高度突變活性,20%人類惡性腫瘤中發現活化的KRAS基因突變,其中就包括高度惡性的胰腺癌、結直腸癌以及非小細胞肺癌。研究者們一直致力於尋求直接靶向KRAS突變基因或間接抑制KRAS基因通路的方法來治療惡性腫瘤,但是,臨床試驗表明目前發現的這些方法並不能使患者獲益。

反義核苷酸(ASO)治療是指與目標基因序列mRNA互補配對的RNA,通過與mRNA結合成雙鏈,實現對目標基因特異性的Knockdown,消除該基因在疾病發生髮展中的作用。本研究證實了反義核苷酸(ASO)AZD4785在治療KRAS突變依賴型腫瘤的重要作用。

二、結果分析

本文有7張大圖:

1. AZD4785高效、高度選擇性下調KRAS mRNA轉錄和蛋白質合成;

2. AZD4785對KRAS野生型和突變型細胞增殖以及MAPK信號通路的影響;

3. AZD4785對MAPK通路的抑制作用不受該通路的負反饋調節;

4. AZD4785在KRAS突變型異基因小鼠肺癌模型中的有效性和葯代動力學;

5. AZD4785在KRAS突變型異基因肺癌PDX模型中的有效性和葯代動力學;

6. AZD4785在KRAS野生型異基因肺癌PDX模型中的有效性和葯代動力學;

7. 小鼠和猴模型研究系統性ASO治療的安全性和耐受性。

Fig.1 AZD4785是經過限制性乙酯化修飾(cEt)的二代ASO,對於野生型和突變型KRAS mRNA 3』非編碼區具有更高的選擇性和抑制活性,並且不需要其他藥物輔助就能夠進入到細胞內。

研究者首先在A431子宮內膜癌細胞中對AZD4785進行研究發現其高度選擇性地使KRAS mRNA選擇性下調,但是不影響同家族的HRAS和NRAS mRNA。

同時ZAD4785相應的使KRAS蛋白表達下降但是不影響HRAS和NRAS基因編碼蛋白的表達。AZD4785對KRAS基因的抑制作用呈現出劑量依賴性。

Fig.2明確了AZD4785對KRAS基因的高度特異性抑制作用後,研究者進一步在肺癌、結腸癌以及胰腺癌細胞中探究了AZD4785引起的KRAS基因表達的缺失對於腫瘤細胞增殖的影響,發現AZD4785對野生型和突變型KRAS基因的表達均有明顯抑制作用,但是只對KRAS突變型腫瘤細胞集落形成有明顯的抑制作用,而對野生型KRAS細胞則增殖則沒有明顯抑制。

進一步研究表明AZD4785僅減少KRAS突變的細胞內MAPK(RAF-MEK-ERK,調節KRAS活性)下游轉錄本DUSP6和ETV4轉錄。蛋白檢測也表明AZD4785僅對KRAS突變型腫瘤細胞MAPK下游通路有抑制作用。說明AZD4785能夠高度特異性抑制KRAS突變細胞的增殖。

Fig.3針對AZD4785對於MAPK通路的影響研究者也進行了研究,發現其僅對KRAS突變的細胞系中MAPK的抑制作用比MAPK特異性的小分子抑制劑效果更明顯,而對野生型KRAS細胞內MAPK下游通路的抑制效果不明顯。

並且與MAPK蛋白抑制劑不同的是AZD4785對於KRAS的抑制作用不受MAPK負反饋調節的影響,這一數據也支持將AZD4785與MAPK抑制劑聯合應用治療KRAS依賴性腫瘤的理論。

Fig.4-7為了進一步探究系統性反義核苷酸(ASOs)治療對於KRAS突變腫瘤的作用以及體內葯代動力學,研究者分別用系統性ASOs的方法治療攜帶有KRAS突變肺癌的裸鼠以及KRAS突變型或野生型的病人來源腫瘤細胞的裸鼠,發現在裸鼠體內,ASOs能夠選擇性下調KRAS,也驗證了系統性ASOs對於KRAS突變型肺癌能夠實現選擇性敲除突變的KRAS。

藥物代謝動力學以及小鼠和猴的模型也進一步證實了系統性ASOs用於治療KRAS突變腫瘤的安全性。

三、套路分析

研究者通過本實驗評估了AZD4785這種靶向KRAS mRNA的經cEt修飾的ASO治療KRAS突變腫瘤的動物模型的療效和安全性。

首先,研究者通過體外實驗比較多種KRAS野生型和突變型細胞系在AZD4785作用下的腫瘤形成能力,評估其對KRAS依賴型腫瘤抑制的特異性和有效性。體外實驗進一步證實AZD4785對於MAPK信號通路下游蛋白的高效、特異性的抑制是其有效殺傷KRAS突變型腫瘤的主要機制。

然後,體內實驗進一步通過系統性ASO治療,通過比較多種腫瘤細胞系以及病人來源的細胞皮下種植模型腫瘤體積大小、KRAS表達敲除情況、以及KRAS下游通路效應分子變化來明確療效。

而該治療方法的耐受性則通過配對腫瘤小鼠和猴模型,主要比較KRAS表達的下調以及組織切片的變化來評估。該實驗為系統性ASO治療KRAS突變型腫瘤的臨床應用奠定了基礎。

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