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Radiology:高大上的影像基因組學在非小細胞肺癌的應用!

導語:NSCLC影像基因組學分析影像學特徵與轉位基因間存在著多重相關性,從而能夠非侵入性的分析NSCLC的分子學特徵。

來源:梅斯醫學

影像基因組學是近年來蓬勃發展的一門新興學科,國內外大部分文獻報道集中在近五年。它將影像學和遺傳學結合起來,用以研究不同基因型的病變的差異。

非小細胞肺癌(NSCLC)患者RNA序列具有特異的基因表達特徵,本研究旨在創建影像基因組學圖將CT影像學表現和基因表達特徵聯繫起來,從而評估癌基因組學圖驗證分子與根據預後意義進行的影像學分型的關係。

本研究共納入了自2008年4月至2014年9月113例診斷為NSCLC患者,並對CT和腫瘤組織資料進行分析。

對於每一處腫瘤,以為胸部放射學醫師記錄87種語義圖像特徵,選擇能夠反映結節形態、邊界、紋理、腫瘤周圍組織關係和整個肺的影像學特徵。然後將所有腫瘤組織中的RNA成分分離出,並利用RNA序列技術進行分析。

10種高度相關表達的基因簇被發現,並命名為轉位基因。該基因在基因譜中得到驗證,其與腫瘤的預後相關。隨後,利用T檢驗和Spearman相關分析並經過多重檢驗驗證得到影像基因組學圖,將語義影像學特徵和轉位基因聯繫起來。

本研究結果為RNA序列分析結果為有10種轉位基因控制著各種分子通路,包括表皮生長因子(EGF)通路。影像基因組學圖包括了32種影像學特徵與轉位基因間的相關性,並有統計學意義。例如,結節密度模糊和邊界與晚期細胞周期基因相關,與EGF通路相關的轉位基因與磨玻璃影、不規則結節和邊界模糊的結節具有相關性。

本研究表明,NSCLC影像基因組學分析影像學特徵與轉位基因間存在著多重相關性,該類基因代表在相應的分子通路,從而能夠非侵入性的分析NSCLC的分子學特徵。

原始出處:

Mu Zhou, Ann Leung, Sebastian Echegaray, et al. Non-Small Cell Lung Cancer Radiogenomics Map Identifies Relationships between Molecular and Imaging Phenotypes with Prognostic Implications.Radiology. 2017.DOI: 10.1148/radiol.2017161845

本文系梅斯醫學(MedSci)原創編譯整理,轉載需授權!

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