預測流感形勢,也許盯緊這幾個人就夠了?
作者:日色提
編輯:odette
星星之火,可以燎原,用這句話來形容流行性感冒病毒的爆髮絲毫不過分。流感病毒非常容易變異,而且傳播速度極快,人群對變異毒株幾乎沒有免疫力。因此,流感不僅每年都會發生不同規模的流行,特定時期還會發生全球性的流行。
凡事預則立,對付流感的最好方法是預防。這就需要我們準確預知下一季流感病毒的突變情況,並提前準備相應的疫苗。遺憾的是,現實相當骨感,按照現有的預測結果,即便疫苗包含多種抗原成分,也難以實現全面保護。
為此,科學家做了很多嘗試,希望能夠更早期更準確地預警流感病毒的突變情況。現在,他們可能獲得了一種全新的思路。
流感防線並不堅固
20世紀以來,已先後發生過四次全球流感大流行,僅1918年的「西班牙流感」就導致至少2000萬人死亡,超過第一次世界大戰的死亡人數。此起彼伏的流感疫情帶來了巨大的疾病負擔,並造成了嚴重的社會影響,這也使流感成為最早建立全球監測網路(即Global Influenza Surveillance and Response System,簡稱GISRS)的傳染性疾病。
GISRS的主要任務有兩個:一是根據全球流感監測結果,每年2月和9月,分別針對北半球和南半球下一個流感季節的季節性流感疫苗候選株,進行預測性推薦;二是監測新型流感的發生,用以及時預警。今年3月2日,WHO在日內瓦召開會議,確認了2017—2018年間製備流感疫苗的毒株。
公正地說,GISRS在流感防控方面居功至偉,但距離全面保護仍有不小的空間。這一點從疫苗有效率就可窺見一斑。疫苗有效率是指與未接種疫苗的人群相比,接種疫苗人群疾病的下降比率。截至目前,2016—2017年流感疫苗有效率估計為48%。從2004年到現在,這個數字起起伏伏,大約介於10%—60%之間。
這其中,預測失准可謂流感疫苗防護力不足的主要漏洞。
回到病毒突變之初
大風起於青萍之末,任何一次流感疫情都有其始作俑者,病毒在宿主身體內部的演化細節,或許能夠給毒株預測提供新的助力,並為防控流感帶來更多啟發。美國華盛頓大學基因組科學系的布魯姆(Jesse D. Bloom)博士領銜的課題組對此展開了探索,他們的研究成果發表在今年6月出版的Elife雜誌上。
通常情況下,對於平素身體健康的成人來說,感染毒性普通的流感毒株後,只需對症治療即可,病程一般不會超過一周。對於研究者而言,想要在如此短的時間窗口內了解病毒的突變狀況,就現有的手段,時長顯然不夠。
不過,在一些免疫力低下的患者中,流感病毒會存在數周乃至數月之久。定期採集這類宿主體內的病毒,並測序分析,科學家就有可能研究病毒在人體內的突變狀況了。
最終,有4名新近完成造血幹細胞移植且又不幸感染了H3N2流感病毒的患者參與了布魯姆的研究。在進行這類手術之前,醫生通常需要使用化療藥物「清髓」,這個措施會使患者的免疫力在相當一段時間內處於較低水平,因此病毒會在他們體內存在很長時間。
研究者定期採集這4位患者的洗鼻液,共得到37份樣品。為了確保數據結果準確,他們將每一份樣品一分為三,而後分別從中分離流感病毒進行測序分析。在流感病毒的組成蛋白中,血凝素(HA)和神經氨酸酶(NA)對流行烈度的影響至關重要,編碼這兩個蛋白的基因也最易發生突變,因此研究者重點分析了這兩處的突變狀況。
最終,研究者共鑒定得到9處高頻突變,其中有5處位於血凝素基因,3處位於神經氨酸酶基因。這些突變不但會在不同患者體內同時出現,而且當科學家將這些突變與全球共享禽流感數據倡議組織(GISAID)旗下的數據進行對比後,發現了更加驚人的結果:這些突變同樣存在於引發疫情的病毒當中,而且在時間線上,前者的發生時間要稍早於後者。
也就是說,不同遺傳背景的流感病毒在免疫力、疾病病程及嚴重程度各自不同的患者體內演化出了相同的突變,這些個別患者體內的突變位點又能在全球流感資料庫中找到印證。
這一切是如何發生的呢?
見微知著
預測病毒演化方向的
新希望
限於研究深度的不足,布魯姆在論文中並未給出這一問題的確鑿答案,但他認為,病毒的生存競爭與選擇壓力是造成上述現象的主要原因。
流感病毒的突變主要在複製過程中發生,攜帶著隨機突變的子代病毒能否將這些突變「發揚光大」,取決於突變能否讓病毒變得更具傳染性,更具生存優勢。
這場生存競爭如同體育比賽。在流感病毒這樣快速突變且行無性生殖的巨大群體中,這樣的賽事不僅全民參與,而且在以難以想像的速度晝夜不停地進行,優勢戰勝劣勢、大優勢戰勝小優勢的選擇性清掃(selective sweep)會使得攜帶較優突變(即高頻突變)的病毒在群體中很快佔據統治地位。
如果研究者能在這些「地區冠軍」(即在個體患者體內贏得生存優勢的毒株)中找到賦予其競爭優勢的命門所在,並預測出「世界冠軍」(即引發大規模疫情的毒株)的特徵,那麼我們在人類與流感的博弈中無疑會贏得先手。事實上,布魯姆的確希望他們的發現將來能夠用於預測流感病毒的演化方向,並幫助其他研究者設計出更有效的疫苗。
不過,在論文中,布魯姆也承認,他們的結果還比較初步,未來還需要在病程較短的正常患者體內觀察病毒的演化。好在,隨著新型研究工具不斷湧現,開展這類研究已經變得越來越容易了。
(編輯:odette)
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