NCBI，UCSC，Ensembl，Uniprot，一次學完統統不要錢

作者：子非魚

現階段，核酸、蛋白以及新葯研究在科研疆域中已然形成了三足鼎立之勢，科研者無不期望能從三個領域中披荊斬棘並殺出一條血路出來，這其中各種艱辛簡直不足與外人道也。

為了給大家點燃一盞指路明燈，教大家如何利用NCBI、UCSC、Ensembl、UniProt四個大名鼎鼎的資料庫，挖掘出大數據海洋中所暗含的生物學規律，特送一波福利。

NCBI/GenBank資料庫

NCBI/ GenBank 建成的世界上最大的基因資料庫。GenBank是一個有來自於70,000多種生物的核苷酸序列的資料庫，每條紀錄都有編碼區（CDS）特徵的注釋，還包括氨基酸的翻譯，主要是科研人員直接提供或來源於大規模基因組測序計劃。

UCSC資料庫

UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 創立和維護的。該站點包含有人類、小鼠和大鼠等多個物種的基因組草圖，並提供一系列的網頁分析工具。站點用戶可以通過它可靠和迅速地瀏覽基因組的任何一部分，並且同時可以得到與該部分有關的基因組注釋信息。如：已知基因，預測基因，表達序列標籤，信使RNA，CpG島，克隆組裝間隙和重疊，染色體帶型，小鼠同源性等。

Ensmbl資料庫

Ensembl資料庫網站開始於一個真核生物基因組注釋項目，其側重於脊椎動物的基因組數據，但也包含了其他生物，如線蟲，酵母，擬南芥和水稻等。隨著時間推移，越來越多的基因組數據已經被添加到了Ensembl，同時Ensembl可用數據的範圍也擴展到了比較基因組學、變異，以及調控數據。

UniProt資料庫

全球蛋白質資源（Universal Protein Resource,UniProt）是全球有關蛋白質方面信息最全面的資源庫。UniProt由UniprotKB、UniRef和UniParc組成是蛋白質序列以及功能信息的集中資源，且其具有最小的冗餘。UniProt是對PIR、TrEMBLe以及Swissprot的信息進行組合而構成的。

UniProt提供了完全分類的、有豐富且準確注釋信息的基於知識的蛋白質序列信息，且有廣泛的交叉引用以及多種查詢界面。

教你GenBank、UCSC、Ensembl、Uniprot的使用

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