科學家對腸癌中蛋白質的研究為腸癌治療提供線索!
【腸癌研究揭示突變對蛋白質網路的影響】科學家們首次完成了對腸癌細胞中許多蛋白質的詳細研究。來自Wellcome Trust Sanger Institute的科學家調查了蛋白質在預測常見突變如何影響癌細胞中蛋白質的作用以及這些蛋白質在預測癌症對治療反應方面的重要作用。
結果,今天(8月29日)在「細胞報告」中發表,使科學家們更好地了解腸癌後的細胞過程,並且可以使研究人員能夠預測哪些藥物可以有效治療不同的腸癌患者。
每天有110人被診斷患有腸癌。每年有大約4100例新病例,是英國第四大癌症。
為了了解癌症的生物學基礎,科學家傳統上研究了所有的癌症基因 - 癌症中的基因組和所有RNA - 轉錄組。然而,研究中的盲點一直是研究所有的蛋白質 - 蛋白質組 - 它是蛋白質,它們是細胞機械的基礎。
在新研究中,科學家對腸癌中的蛋白質進行了深入細緻的研究,以研究蛋白質在預測不同藥物對癌症的作用方面發揮的作用。研究人員分析了50種腸癌細胞系中的9,000種蛋白質。
來自Wellcome Trust Sanger研究所和倫敦癌症研究所的主要作者Jyoti Choudhary博士說:「這項研究是結腸直腸癌細胞系的第一次詳細表徵,重要的是將蛋白質組學納入癌症研究中,因為蛋白質是已知蛋白質組合和功能的獨特信息,過去的基因組和轉錄組研究已被證明是癌症研究中的一個盲點 - 但現在包括蛋白質組,我們有全貌。」
該團隊能夠構建促進腸癌的蛋白質協調網路。研究人員使用CRISPR-Cas9來破壞或敲除編碼關鍵蛋白質的單一基因,並觀察其網路中蛋白質的影響。
威康信託桑格研究所的第一作者Theodoros Roumeliotis博士說:「我們發現,沉默一個基因會對網路的其餘部分產生影響,減少了其他蛋白質的數量,就像一個漣漪效應一樣,我們已經確定了蛋白質網路可以用於腸癌藥物,我們只能通過研究蛋白質組來發現。」
在研究中,該小組在50個腸癌細胞系中測試了265種現有的抗癌藥物。以前已經將基因組和轉錄組的細節用於預測哪些藥物在特定癌症病例中起作用,但是某些藥物的活性無法預測。
通過研究蛋白質組,該團隊可以預測未被基因組學或轉錄組學解釋的藥物反應。
Wellcome Trust Sanger研究所的資深作者Ultan McDermott博士說:「這項研究對腸癌患者有希望,它證實這種常見的癌症實際上由五種不同的亞型組成,可能需要不同的藥物治療,令人驚訝的是,蛋白質可能比我們以前認為的更容易預測藥物敏感性,未來我們可能需要測試患者的基因組,轉錄組和蛋白質組,以充分預測其對癌症藥物的反應,並更有效地分層患者進行臨床試驗。一切都適合個性化醫學。」
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