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天天共享!共享DNA數據或泄露個人隱私

編者按:共享單車、共享電車、共享汽車,當DNA數據也伴著共享浪潮襲來。人類的隱私又該當如何?

一股批評的浪潮席捲了基因組測序的先驅者雷格?文特爾發表的一篇論文,該論文聲稱能從DNA數據中預測人們的生理特徵。審稿人,甚至文章的共同作者卻表示說,論文誇大了使用一個人的基因識別個人的能力,這可能會引起對基因隱私問題不必要的恐慌。

在9月5日發表於美國國家科學院院報(PNAS)的論文中,來自位於加利福尼亞州聖地亞哥的人類壽命公司(Human Longevity,Inc.,HLI)的文特爾(Venter)和同事們一道,對1061位來自不同年齡階段和種族背景的人的全部基因組進行了測序。藉助遺傳數據和受試者臉部的高質量3D照片,研究人員利用人工智慧來尋找與類似臉頰骨一類面部特徵相關的DNA序列中的微小差異(被稱為SNP,單核苷酸多態性)。該小組同時還搜索了與包括人的身高、體重、年齡、嗓音特徵和皮膚顏色等因素相關的SNP。

該方法能以74%的準確率從HLI資料庫隨機選出的十人當中識別出正確的那個人。研究結果顯示,處理人類基因組的執法機構、科學家和其他人員應該保護基因數據,防止個人隱私僅憑藉DNA就被識別出來。HLI在一份聲明中表示:「HLI的研究人員的一個核心理念就是,現在能夠公開訪問的資料庫沒有真正做到去識別化,因此不能保護個人隱私。」

有爭議的斷言

但是,其他基因學家在研究閱讀該文章後認為,這個說法被大大的誇大了。賓夕法尼亞州立大學的人類學家馬克·施里弗(Mark Shriver)說:「我不認同文章提出的這些風險,因為他們不能證明僅僅藉助DNA就能找出一個人。」

他說,在被隨機選擇出的10人中進行選擇,加上數據來源還是類似HLI這種規模不大、多樣性有限的資料庫,單單藉助性別和種族就能排除掉大多數人。

為了證明這一點,紐約哥倫比亞大學的計算生物學家亞尼夫·艾麗希(Yaniv Erlich)研究了HLI文章中的年齡、性別和種族數據。在於9月6日發表在bioRxiv預印本伺服器上的一篇研究中,他計算出,僅憑藉這三個特徵就足夠以75%的準確率識別出從HLI資料庫選出的十人當中的正確的那個人。艾麗希認為,根本就沒必要了解人們的基因組就能做到這點。此外,他還表示,HLI對SNP引導的面部結構重建並不具有高度特定性——他們傾向於把個體單純視作相同性別和種族中的任意一個人。

在論文發表於PNAS之前,該論文曾被提交給《科學》雜誌。《科學》雜誌此前的審稿人施賴弗表示,HLI的實際數據是可靠的,他對該組藉助對會隨著時間的推移而縮短的染色體末端進行測序來確定年齡的新穎方法也印象頗深。但是,這篇文章不能證明它所聲稱的能通過DNA識別一個人這一斷言。他說:「我認為它完全錯誤的闡述了他們所進行的工作和得到的發現。」

HLI表示,它的論文指出,在分析超過1000個基因組的資料庫的基礎上,使用多個特徵(人臉就是其中一隻)有可能找出一個人。HLI發言人希特爾·爾科瓦爾斯基(Heather Kowalski)還認為「並且預測會變得越來越準確。」HLI表示,預測是就方法論而言的,但也承認數據規模很小。該公司補充說「團隊正在努力對亞尼夫在BioRxiv上提出的批評進行反駁。」

施賴弗說,他和艾麗希都在《科學》雜誌的審稿意見中提出了對研究作者的關切,並指出《科學》最終拒絕刊發這篇文章(《科學》雜誌不對未被其發表的研究進行評論)。之後,論文被轉而提交給PNAS,PNAS允許類似文特爾這樣的美國國立科學,工程和醫學學院的成員自主選擇審稿人。三個審稿人中兩個是信息隱私專家,另外一個是生物倫理學家。

PNAS證實,文特爾確實選擇了這三位作為他們研究的審稿人。HLI拒絕對PNAS的同行審議過程發表評論。

隱私問題

現在在新加坡蘋果公司工作的計算生物學家,同時也是本文共同作者的傑森·派珀(Jason Piper)同意說該論文歪曲了他和其他共同作者的發現。派珀補充表示,他在與公司的合同中放棄了在提交論文前對稿件進行批准的權利,允許HLI將他的數據以任何看上去合適的方式進行詮釋。HLI對此的回應是,確認表示「作者被給予了對論文進行審查和評論的機會。」

派珀此前在推特上批評了這篇論文,表示HLI是鼓勵限制訪問DNA資料庫的利益相關者。公HLI是商業公司,如今正試圖建立世界上最大的人類遺傳信息資料庫。

「我認為遺傳隱私是非常重要的,但(LHI建議)採取的途徑是錯誤的,」派珀說,「為了能從基因組中獲得更多的信息,分享必不可少。」更有效的途徑是找出一種在能公開基因組數據的同時避免個人被認出的方法。

針對該文章的批評,HLI公司以一項聲明作為回應,表示「HLI支持對基因組數據進行保護,並促進現代數據交換解決方案的實施。」他們補充說,本文旨在激發關於共享遺傳信息的同時保護個人隱私問題的討論。

儘管如此,艾麗希仍擔心文特爾的數據在政策制定者的眼中被給予額外的重視,導致他們過分憂慮DNA隱私。他說:「新的規章制度就是基於這類論文產生的,當我們處理隱私風險時,搞對事實是很重要的。」

原標題:文特爾再引爭議:共享DNA數據泄露個人隱私? | 創技術

來源:創新地標、圖片來源於網路

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