如何查找已知lncRNA信息？有圖有步驟

lncRNA作為發現相對較晚的一種長鏈非編碼RNA，近幾年的研究如火如荼。如果你的手裡有一堆關於人研究相關的lncRNA數據，想看看有哪些已經有過研究報道，小編推薦一款常用的lncRNA資料庫-LNCipedia（對人類的長鏈非編碼RNA的序列和結構全面注釋）。https://lncipedia.org/。資料庫整合了不同來源已注釋的146742個的人lncRNA轉錄本。除了基本的轉錄本信息和結構，還對二級結構信息，蛋白編碼潛能和miRNA結合位點做了統計。

那麼，如何在該資料庫查找已知lncRNA信息？

A. 如果已有在該資料庫注釋的gene id或轉錄本id，例如，lnc-OR4F29-1，可以直接輸入點擊search。在source一欄有各資料庫選項，可以直接選擇all。

B. 如果已知該轉錄本序列信息，可以直接輸入該序列，點擊search。

（1） 搜索輸入界面如下：可以直接輸入 ID ，也可以輸入序列。

（2） lnc-OR4F29-1，輸入之後，搜索結果包括27個lncRNA轉錄本，我們可以看到表格給出了每個轉錄本的位置，正負鏈和長度信息。可以點擊進去查看每個轉錄本的詳細信息。也可以直接點擊lncRNA gene ID查看。

（3）點擊某一個轉錄本，如lnc-OR4F29-1:1。顯示該轉錄本的詳細信息，包括分類、來源、序列信息、物種間位點的保守性、編碼潛能、有無靶向miRNA等。

總結

lncipedia 是專門研究人已知lncRNA注釋信息的資料庫，看到這，您可以對手裡的數據進行檢索，或者也可以直接下方留言直接聯繫我們哦~

多多關注微信號更新，更多RNA研究的資料庫，後續小編將為您呈上！

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