最新《Nature Methods》報道「顯微鏡成像技術」重要技術成就
冷凍電子斷層掃描術(Cryo-electron tomography)讓科研人員有能力詳細了解細胞內部微觀結構。過去,剖析單個細胞的三維結構通常需花費一周時間,如今,僅需用時1小時!
這項自動化新技術的開發團隊來自貝勒醫學院和新加坡國立大學,未來科學家們將能在短時間內處理海量的多品種細胞,從而全局地詳細了解整個細胞和疾病進程。這項重大技術性突破發表在Nature子刊《Nature Methods》雜誌。
「冷凍電子斷層成像術是可視化細胞內部結構的強大武器,其解析度是世界上最高等級的光學顯微鏡的100倍,」文章通訊作者、貝勒醫學院計算與整合生物醫學研究中心副主任Steven Ludtke教授說。
目前,除非使用冷凍電子斷層成像,其他任何手段都無法直接獲取細胞內部進程信息,包括正常或疾病細胞微環境變化等。「然而,這項技術需要耗費大約1周手動工時才能完成一個細胞內部所有細節和結構的標註,這嚴重限制了技術的推廣和使用,」Ludtke說。
為了提高效率,Ludtke和同事開發了自動化的方法便捷方法。用不同類型細胞(如人血小板、非洲錐蟲、藍藻等)進行測試,並與傳統方法比較,結果顯示新方法可以準確地確定細胞內部結構,並具有很高的精確度。
原文標題
Convolutional neural networks for automated annotation of cellular cryo-electron tomograms
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