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細胞計數快准狠,還得靠ImageJ這兩把刷子!

作者:子非魚

轉載請註明:解螺旋·臨床醫生科研成長平台

遙想當年,初遇細胞實驗時,最讓小編頭疼的就是給細胞計數了。雖然計數板這個傻瓜式檢測方法比較簡單粗暴,但總會讓人暈頭轉向、數到眼瞎,而且萬一一個不小心被其他人打斷了思路,分分鐘前功盡棄,真是恨不得以頭搶地爾。

然而各位小夥伴之所以覺得數細胞如此辛苦,是因為大家還沒有掌握細胞計數的正確操作。此時,ImageJ這個大家耳熟能詳的圖像操作軟體,攜帶著兩大法寶,可快速將大家從數細胞這個大坑中解救出來。

法寶一:多點工具法

1. ImageJ打開一張需要計數的圖片。

2.激活多點工具。其位置在點工具菜單里,右擊點菜單,選擇多點工具。

3.直接在圖中點擊目標即可,軟體會自動在點旁邊出現數字代表數量。

4: 雙擊點工具菜單,可以修飾點的形狀(Type)、顏色(Color)、大小(Size)。但記住勾選 Label points。

5: 若點選錯誤,可以按住Alt,然後單擊點,就會去除點,並且重新計數。

法寶二:閾值分割法

1. 將圖像拖動到Image J工具箱中,點擊Image > Type > 8-bit ,將圖片變為黑白圖,細胞為白色,背景為黑色。

2. 反轉圖片,Edit>Invert,使得細胞為黑色,背景為白色。隨後調整閾值, Image>Adjust>Threshold,通過閾值窗口中的滑塊調節合適的閾值,將目標包含在閾值內。調節合適後,點擊閾值窗口中的應用Apply,則調節好的區域就變成黑色區域。

3.Analyze>Analyze Particles。彈出窗口,Size表示設定以像素為單位的區域大小是我們想要計數的。勾選Display results(顯示結果),Clear results,Summarize(總數)即可。也可以在Show下拉菜單選擇Outlines,展示區域輪廓。

4.點擊OK,彈出結果窗口,從中我們可以看到細胞總計數,也可以看到目標區域的整體面積,以及每個目標區的面積。

參考文獻:Quick and Easy Automatic Cell Counting

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