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Cell:被「忽視」的DNA序列,竟負責啟動免疫細胞的發育

Cell:被「忽視」的DNA序列,竟負責啟動免疫細胞的發育

「自然是如此的奇妙!「——加州大學聖地亞哥分校生物科學系教授Cornelis Murre略帶感慨的說道。

不久前,正是Cornelis Murre和他的團隊,通過分析小鼠的基因組發現,非編碼區負責改變DNA的三維結構,從而促使啟動子和增強子精準地結合。

業內人士熟知,啟動子(Promoter)位於基因上游區域,是控制基因表達的「開關」,負責調控基因轉錄起始時間和表達程度。增強子(enhancer)是強化轉錄起始的DNA序列,必須與啟動子配對才能實現「強強聯合」。

但是在物理距離上,啟動子和增強子常常相隔較遠,它們是如何響應彼此的呢?如果這些元素不同步易引發白血病、淋巴瘤等疾病,這背後有哪些機制呢?

此次,Cornelis Murre和他的團隊以免疫系統發育為切入點,在被忽視的DNA片段中找到了答案!

Cell:被「忽視」的DNA序列,竟負責啟動免疫細胞的發育

DN2a T 細胞發育成DN2b T細胞的示意圖。這一發育過程由非編碼DNA序列調控,當該序列發生缺陷,DN2a T 細胞將無法正常發育,從而易引發白血病、淋巴瘤等疾病。(圖片來源:加州大學聖地亞哥分校)

此前,已有研究證實增強子Bcl11b負責調控T細胞的發育。Cornelis Murre和團隊發現,在發育的T細胞中,Bcl11b增強子會從核纖層轉移至核內部

那麼,影響增強子改變定位的調控因子是什麼?他們進一步發現,這是一段非編碼序列ThymoD(thymocyte differentiation factor,胸腺細胞分化因子)。當ThymoD缺陷時,小鼠體內的T細胞發育會受阻,從而易引發淋巴惡性腫瘤。

正是基於這樣的事實,Cornelis Murre教授判定——ThymoD會改變DNA的三維結構,從而促使啟動子和增強子精準地結合!

他還將這一機制描述為「牽引線」——增強子、啟動子各佔兩端,當線連成環,兩基因元件就結合在一起了,並定位在某一特殊位置。一旦增強子和啟動子分開,它們會被牽引著重新定位,從而促進免疫系統的構建。

Cell:被「忽視」的DNA序列,竟負責啟動免疫細胞的發育

ThymoD序列通過改變增強子Bcl11b的核定位和三維結構,從而調控免疫系統的發育、抑制白血病和淋巴瘤的發展。(圖片來源:加州大學聖地亞哥分校)

「我們認為基因組是一種非結構化的序列。但是事實上,我們發現它是一種被高度結構化和設計過的。我們最新發現的機制,允許增強子和啟動子在精準的時間點、在三維的結構里找到彼此。有意思的是,這一切都是精心策劃的。」 Cornelis Murre教授解釋道。

當這種機制失效,T細胞發育會發生故障,從而易引發淋巴瘤和白血病等疾病。而且,這一機構不僅僅影響正常的T細胞發展,還在某種程度上調控腫瘤抑制性。

參考資料:

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