生命與健康大數據研究獲進展

1月4日，《國際核酸研究》（Nucleic Acids Research）資料庫專刊，連登四篇中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據研究成果，包括生命組學數據資源建設成果（D14-20）、實時定量PCR內參基因知識庫——ICG（Internal Control Genes；D121-126），甲基化資料庫Methbank升級版（D288-295）以及基因組序列變異庫——GVM（Genome Variation Map；D944-949）。四篇文章的發表，標誌著我國綜合型生物信息資源庫建設獲得國際同行進一步認可。

自上世紀60年代以來，國際生物信息學家建立了一系列的資料庫。特別是上世紀90年代，隨著人類基因組計劃的展開以及網路在全球普及，資料庫數量和體量迅猛增加，形成了以NCBI、EBI、DDBJ等為代表的多個國際大數據中心。隨著測序技術不斷發展，我國已成為國際基因組數據最大產出國之一，但我國產出的組學數據絕大部分必須提交到國外資料庫才能得到認可。據Database Commons資料庫統計，我國資料庫資源總數已位居世界第二，但大部分資料庫沒有進行長期運行維護，嚴重缺乏深度人工審編，資料庫內容邊緣化，最終結果是大量資料庫資源質量不高，利用率低。

北京基因組所面向國家大數據發展戰略和科技創新戰略，成立生命與健康大數據中心，建立生物大數據儲存、整合與挖掘分析研究體系，構建的GSA（Genome Sequence Archive）資料庫已開展原始組學數據存儲與共享服務，並與國際接軌，存儲的數據已支持Cell、Nature Communications、PNAS、Genome Research等雜誌文章發表，建成我國生物大數據匯交共享平台，成為繼NCBI、EBI、DDBJ之後第四個綜合基因組權威資料庫。同時，建成生物大數據多層次組學層面的數據資源體系，包括基因組歸檔資料庫Genome Warehouse、基因組變異資料庫Genome Variation Map、基因表達資料庫Gene Expression Nebulas、甲基化資料庫Methylation Bank、生物知識庫Science Wikis，對我國科學研究和產業創新發展起到了重要支撐作用。

來源：中國科學院北京基因組研究所

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