復旦大學在被子植物系統進化研究領域取得新進展

2018年1月6日，Molecular Plant在線發表了復旦大學生命科學學院遺傳工程國家重點實驗室、遺傳與發育協同創新中心馬紅教授和戚繼研究員為通訊作者的題為「Wide-Spread Whole Genome Duplications Contribute to Genome Complexity and Species Diversity in Angiosperms」的研究論文。該研究揭示了全基因組重複事件在被子植物基因組複雜性和物種多樣性中的作用。

基因重複（gene duplications, GDs）為產生新功能提供了進化潛力，而多倍體化或全基因組重複（whole genome duplication, WGD）使得染色體倍增，併產生成百上千個保留重複。WGD事件得到了許多物種豐富的真核生物譜系中常見證據的強烈支持，因此WGD被認為是物種多樣化的主要驅動力之一。研究人員對覆蓋被子植物主要譜系的59個公共基因組/轉錄組和46個新測序的轉錄組數據進行了比較基因組和系統發育分析，通過對數以萬計的基因家族進化樹進行分析，從而檢測大規模的基因重複事件。這些分析證實了先前報道的大部分WGD，並為許多譜系的新WGD提供了有力證據。檢測到的WGD支持進化過程中的指數基因丟失模型，估計其半衰期約為2160萬年，並且與高度多樣化的譜系出現和全球氣候變化時期相關。該研究所採用的新數據和分析方法檢測到被子植物進化過程中許多廣泛傳播的新WGD，並揭示了基本細胞代謝中基因功能的優先保留，為WGD在促進被子植物擴張和增強環境適應方面的作用提供了線索。

Figure 2. A model for exponential decrease over time of number of duplication events, with actually detected GDs.

文章下載地址：

鏈接:https://pan.baidu.com/s/1kUBfK95

密碼:fpjq

喜歡這篇文章嗎？立刻分享出去讓更多人知道吧！