20款經典生物在線工具匯總
來源 | 安諾基因、佛雷塞斯
Promoter Scan
功能：啟動子預測
網址：https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/
ORF Finder
功能：ORF預測
網址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
NCBI-BLAST
功能：序列比對
網址：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
MUSCLE
功能：運行速度比較快的多序列比對
Clustal Omega
功能：DNA、RNA、蛋白的多序列比對
ClustalW2
功能：應用較廣泛的多序列比對
T-Coffee
功能：準確度高,速度慢的多序列比對
SimiTriX-SimiTetra
功能：多序列比對相似性展示
Venn圖
功能：繪製Venn圖
網址：http://bioinformatics.psb.ugent.be/cgi-bin/liste/Venn/calculate_venn.htpl
WEGO
功能：繪製GO注釋結果圖
網址：http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl
CIRCOS
功能：繪製圈圖
CIRCexplorer
功能：進行circRNA分析
iPath
功能：進行可視化通路圖在線分析
網址：http://pathways.embl.de/
KEGG
功能：進行基因的代謝通路注釋
UCSC
功能：進行基因組可視化
IBS
功能：進行序列結構示意圖繪製
RAP
功能：在線分析RNA-seq
網址：https://bioinformatics.cineca.it/rap/
AUGUSTUS
功能：基因外顯子內含子，UTR,注釋
網址：http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create
GSDS
功能：基因外顯子內含子，UTR,domain等區域特徵展示
網址：http://gsds.cbi.pku.edu.cn/
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