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世界熱點論文分析:在預後和治療中基因組研究前景無限

本文刊載於《科學觀察》2011年第6卷第6期P74-P75。如果您喜歡,歡迎訂購我刊。版權所有中國科學院文獻情報中心《科學觀察》編輯部。未經許可,不得轉載。

在預後和治療中基因組研究前景無限

David W Sharp《柳葉刀》雜誌特約編輯

2011年6月至7月中旬,僅僅7個星期的時間,至少出現20篇關於單核苷酸多態性(SNP)的論文,該SNP位於19號染色體IL28B基因附近,IL28B編碼III型干擾素。這種論文發表速度令人震驚。引發這一現象的始作俑者是目前位於熱點論文榜第6位的論文,2011年3—4月,其在熱點論文資料庫中的總被引達279次。

該論文表明,對於特定的C型肝炎,在IL28B上的遺傳學變異能夠幫助臨床醫生和患者預測治療的反應(聚乙二醇干擾素和利巴韋林是目前的標準治療方法)。隨後發表在Nature上的一篇論文(D.L. Thomas,et al., Nature,461[7265]: 798-801, 2009;總被引頻次160,最新引用頻次43)目前位於第25位,關注的是C型肝炎的自然病史,而論文#6早其3周發表,研究了治療反應中持續的病毒清除。

該單核苷酸多態性,即所謂的rs12979860,是通過全基因組相關分析發現的。這種遺傳學標記物需要證實。對於rs12979860和C型肝炎,證據來得迅速並一致。例如,一項統計學結果表明對於抗病毒治療反應,基因型CC是最強的預測因子(T.R. O』Brien,et al., PLoS One, 6[7]: e20904, 2011 [Epub July 8, 2011])。這種基因配型現在能夠很快完成(例如R. Melis R,et al., J. Mol. Diag., 13[4]: 446-51, 2011),並且在這篇影響深遠的論文發表後一年內,就建立起針對IL28B基因配型設計的C型肝炎治療試驗。

針對黑色素瘤的新藥物(vemurafenib或者PLX4032)在今年早期的腫瘤會議上引起了廣泛關注,前一期即2011年7/8月的熱點論文分析對此進行了評論。這個話題值得多談一些,因為本期的論文#11進行了該藥物的I期研究(K.T. Flaherty,et al., New Engl. J. Med.,363[9]: 809-19, 2010;總被引116次,本期被引62次)。

大約有一半的黑色素瘤都帶有編碼一種稱為BRAF的激酶的基因突變,而對於帶有這種突變的BRAF,vemurafenib是強有力的抑製劑。至少有其他三種針對相同靶點的藥物正受到關注。儘管該研究關注的是藥物的劑量和毒性,但是也記錄到了令人鼓舞的腫瘤對藥物的反應。據報道,一項III期臨床試驗正在進行——事實上,我們已經得到該試驗的6個月的結果(P.B. Chapman,et al., New Engl. J. Med.,364[26]: 2507-16, 2011)。

未接受過治療的轉移性黑色素瘤和帶有該特異性突變的675名患者參加了該隨機試驗,比較vemurafenib和dacarbazine的效果。對於新葯,患者總的存活率為84%,而對照組為64%,因此試驗監督委員會建議將使用dacarbazine藥物的患者改為使用vemurafenib。藥物批准程序正在美國和歐洲的認證機構進行,對於突變的快速診斷檢測也在研發之中。

如果證實vemurafenib正是我們所希望的重要發現,那麼對於參與基因個性化癌症治療研究的每個人都將是巨大的鼓舞,因為這一研究過程包含太多的沉浮。Vemurafenib本身也經歷了這種「過山車式的突破和障礙」(如同2010年2月Amy Harmon在《紐約時報》上關於該藥物的系列報道中所記錄的內容)。

這一進展是基礎研究公司和製藥工業共同合作的結果——實際上,研究vemurafenib的羅氏公司(Roche)和研究ipilimumab(上個月的ScienceWatch.com中討論的抗黑素瘤製劑)的百時美施貴寶公司(Bristol-Myers Squibb),正在就兩種藥物的聯合使用進行合作。

所有這些研究進展,追根溯源要歸功於9年前英國Wellcome Trust慈善基金會的醫學研究基金資助的那個項目——癌症基因組計劃(H. Davies,et al., Nature,41[6892]: 949-54, 2002)。

翻譯:接英 審校:馬建華

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