少量樣本發高分又一力作！

喜報：近日，美吉客戶在國際著名學術期刊《Environmental Microbiology》發表了題為「Strong impact of anthropogenic contamination on the co-occurrence patterns of a riverine microbial community」的研究性文章，在研究人為污染對河流微生物群落共現性模式影響方面取得新進展。論文第一作者是中國科學院城市環境研究所的胡安誼老師。

很多研究者深有體會：水體微生物多樣性文章越來越難發了，尤其是高分文章，前行之路在何方？Waiting，咱們胡老師有話說：「有關注過人為污染對河流微生物群落的影響嗎？有研究過河流微生物組的共現性網路嗎？」「這個還真沒有！」Follow me，今天，胡老師手把手教你：好的idea加完美的實驗設計，高分文章咱們照樣發！

研究背景

在河流生態系統中，一些微生物類群被稱為典型淡水細菌（TFB），這些細菌不僅僅存在於湖泊中，還存在於河流和溪流中。理化因子包括溫度、pH、溶氧、氮和磷含量都會在一定程度上影響河流微生物組成。而人類活動的產物如藥物和個人護理品（PPCPs ）是影響河流微生物組成的潛在選擇力量。

共現性網路是最近被用來分析海洋、湖泊、土壤、污泥等環境微生物種內或種間互作關係的一種方法。研究揭示微生物群落一般具有非隨機共現性模式和模塊結構，這表明生物互作在群落組成和生態系統功能中發揮著重要作用。此外，在生態網路內，一些中心或關鍵物種在維持整個微生物群落的結構和功能中也起著不可替代的作用。

實驗設計

3個不同的時間段（1月、6月和9月）分別從福建九龍江20個採樣點（如下圖所示）共收集60個水體樣本，利用Illumina MiSeq平台對16S rDNA V4-V5區進行測序，研究人為污染物對河流微生物群落共現性模式的影響。

研究結果

1. 河流微生物共現性網路具有非隨機的模塊化結構，主要受共現性物種的分類關係的影響；

2. 糞便指示菌可以在河水中生存很長一段時間，但是它們會形成一個獨立的模塊，與典型淡水細菌之間幾乎無相互作用；

3. 營養物質和微污染物（如藥物和PPCPs）聯合影響河流微生物的α和β多樣性；

4. 與理化因子相比，個人護理用品對河流核心物種和模塊群落的破壞性影響更加強烈。

研究結論

研究結果表明，人為污染強烈影響河流微生物群落多樣性，並且對河流核心物種和共現性模式具有更加強烈的破壞性影響。總的來說，該研究將為遭受人為壓力的水生環境中微生物群落的構建提供新見解。

參考文獻：

Hu A, Ju F, Hou L, et al. Strong impact of anthropogenic contamination on the co-occurrence patterns of a riverine microbial community[J]. Environmental Microbiology, 2017.

微生態事業部 文案高 偉

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