確定細胞何時具有「cdna」RNA「檢查」由活性基因寫入的方法

【博科園-科學科普-留言評論或建議有驚喜哦~( ^_^)】DNA通常被稱為「生命之書」，但這個流行的說法讓一些生物學家感到不安。誠然DNA承載著我們的基因，它闡明了我們的細胞用來製造蛋白質的指令——那些構成我們身體的工作馬分子，並使生命中的每一件事都成為可能。但是基因編碼的蛋白質「藍圖」與特定細胞的蛋白質含量之間的精確關係並不清楚。當一個基因被激活和其消息複製到一個RNA分子,生物學家可以不再一定知道如果它導致製造的蛋白質比銀行家知道支票寫的它的一個客戶最終會被兌現。多虧了DNA和RNA測序的進步，生物學家非常擅長於了解基因的編碼在任何時刻被複制到RNA信息中，這是製造蛋白質的第一步。

對DNA雙螺旋結構的描述，四個編碼單元(A、T、C、G)分別用粉色、橙色、紫色和黃色標註。圖片版權：NHGRI

但是他們不太擅長找出這些RNA信息到底是如何快速地從終端到細胞工廠，被稱為核糖體，在那裡合成蛋白質。現在來自冷泉港實驗室(CSHL)、石溪大學(SBU)和約翰霍普金斯大學(JHU)的多學科研究團隊已經發布了軟體，可以幫助生物學家更準確地確定這一點。使用單細胞酵母菌和常見的微生物大腸桿菌來演示他們的新程序叫做scikitribo。scikito - ribo就像一套數學矯正鏡片，設計成「放置於」2009年推出的一種方法，名為Riboseq。後者揭示了細胞將RNA轉化成蛋白質的速度和速度。CSHL和JHU的定量生物學家Michael Schatz博士說，這是一個巨大的進步，他與CSHL的博士、醫學博士、醫學博士、博士、博士、SBU的一名剛畢業的博士的工作密切相關。方才知道如何構建矯正鏡片，使核糖體數據能夠被聚焦。

使用先進的統計建模技術來解釋核糖體不是以統一的速度工作，而是傾向於暫停——例如，當它們在傳入的RNA信息中遇到髮夾形狀的扭結時。scikito -ribo也過濾出了雜訊，這些雜訊干擾了Riboseq的原始結果。現在，這兩種方法可以一起使用來生成更準確的圖像，在特定的核糖體上讀取RNA信息，也許最重要的是，產生了多少功能蛋白。實際上製造的蛋白質的數量可能與給定基因表達的數量是相同的。有一個更可靠的了解方法將有助於疾病研究。CSHL的里昂在2011年發現的一種罕見的人類發展疾病——奧格登綜合征(Ogden Syndrome)的背景下，利用scikito - ribo來探索核糖體將某些RNA信息轉化為蛋白質的能力。在這種情況下，新的方法被用來研究在核糖體翻譯中的錯誤可能與疾病因果關係有關的假設。

知識：科學無國界，博科園-科學科普

參考：Cell Systems

內容：經「博科園」判定符合今主流科學

來自：冷泉港實驗室

編譯：雙螺旋

審校：博科園

解答：本文知識疑問可於評論區留言

傳播：博科園

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