利用重測序、高密度遺傳圖譜和轉錄組數據重新組裝注釋高粱參考基因組

近日，美國德克薩西州立大學在Plant J在線發表題為「The Sorghum bicolor referencegenome: improved assembly, gene annotations, a transcriptome atlas, andsignatures of genome organization」的文章。該研究利用二代深度測序、437個重組自交系產生的高密度遺傳圖譜及轉錄組數據對高粱參考基因組進行重新組裝和注釋。本次組裝和注釋補充了原參考基因組的gaps，增加了29.6Mb的數據；基因注釋增加了24%，達34，211個；鹼基錯配率降低了10倍。重新鑒定了~7.4M SNPs和1.8M indels。參考基因組數據的更新在高粱作為C4模式植物和高粱遺傳改良中具有重要意義。

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