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PCR儀操作與維護,給你提煉一篇

今天來給大家整理下pcr實驗操作注意事項及常見問題、維護指南。

簡單的說,PCR就是利用DNA聚合酶對特定基因做體外或試管內In Vitro的大量合成,基本上它是利用DNA聚合酶進行專一性的連鎖複製。

目前,常用的技術,可以將一段基因複製為原來的一百億至一千億倍。根據DNA擴增的目的和檢測的標準,可以將PCR儀分為普通PCR儀,梯度PCR儀,原位PCR儀,實時熒光定量PCR儀四類。

實驗操作注意事項:

儘管擴增序列的殘留污染大部分是假陽性反應的原因,樣品間的交叉污染也是原因之一。因此,不僅要在進行擴增反應是謹慎認真,在樣品的收集、抽提和擴增的所有環節都應該注意:

1.戴一次性手套,若不小心濺上反應液,立即更換手套;

2.使用一次性吸頭,嚴禁與PCR產物分析室的吸頭混用,吸頭不要長時間暴露於空氣中,避免氣溶膠的污染;

3.避免反應液飛濺,打開反應管時為避免此種情況,開蓋前稍離心收集液體於管底。若不小心濺到手套或桌面上,應立刻更換手套並用稀酸擦拭桌面;

4.操作多份樣品時,製備反應混合液,先將dNTP、緩衝液、引物和酶混合好,然後分裝,這樣即可以減少操作,避免污染,又可以增加反應的精確度;

5.最後加入反應模板,加入後蓋緊反應管;

6.操作時設立陰陽性對照和空白對照,即可驗證PCR反應的可靠性,又可以協助判斷擴增系統的可信性;

7.儘可能用可替換或可高壓處理的加樣器,由於加樣器最容易受產物氣溶膠或標本DNA的污染,最好使用可替換或高壓處理的加樣器。

如沒有這種特殊的加樣器,至少PCR操作過程中加樣器應該專用,不能交叉使用,尤其是PCR產物分析所用加樣器不能拿到其它兩個區;

8.重複實驗,驗證結果,慎下結論。

PCR主板,控制整個機器運行

來源:網友:70碼

具體歸類為以下常見的4點,描述如下:

問題一:無擴增產物

現象:正對照有條帶,而樣品則無

原因:

1、模板:含有抑制物,含量低

2、Buffer對樣品不合適

3、引物設計不當或者發生降解

4、反應條件:退火溫度太高,延伸時間太短

對策:

1、純化模板或者使用試劑盒提取模板DNA或加大模板的用量

2、更換Buffer或調整濃度

3、重新設計引物(避免鏈間二聚體和鏈內二級結構)或者換一管新引物

4、降低退火溫度、延長延伸時間

問題二:非特異性擴增

現象:條帶與預計的大小不一致或者非 特異性擴增帶

原因:

1、引物特異性差

2、模板或引物濃度過高

3、酶量過多

4、Mg2+濃度偏高

5、退火溫度偏低

6、循環次數過多

對策:

1、重新設計引物或者使用巢式PCR

2、適當降低模板或引物濃度

3、適當減少酶量

4、降低鎂離子濃度

5、適當提高退火溫度或使用二階段溫度法

6、減少循環次數

問題三:拖尾

現象:產物在凝膠上呈Smear狀態

原因:

1、模板不純

2、Buffer不合適

3、退火溫度偏低

4、酶量過多

5、dNTP、Mg 2+濃度偏高

6、循環次數過多

對策:

1、純化模板

2、更換Buffer

3、適當提高退火溫度

4、適量用酶

5、適當降低dNTP和鎂離子的濃度

6、減少循環次數

問題四:假陽性

現象:空白對照出現目的擴增產物

原因:

靶序列或擴增產物的交叉污染

對策:

1、操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內或濺出離心管外;

2、除酶及不能耐高溫的物質外,所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管及加樣槍頭等均應一次性使用。

3、各種試劑最好先進行分裝,然後低溫貯存

儀器的維護保養

需要注意以下問題:

實驗室使用的基因擴增儀,熒光定量PCR儀都是高精度儀器。一旦儀器出現一些溫度或者檢測上的小偏差,則很可能對實驗結果產生較大的影響。因此,學會日常保養和維護是尤為重要的。

1、儀器安置

儀器應安放在濕度較低、灰塵較少並遠離水源和熱源的地方,無腐蝕性氣體或強磁場干擾。

環境溫度建議在18~35℃之間。儀器之間應保持50cm 以上距離,降低儀器之間的影響。

2、樣品台、熱蓋定期清潔

用95%乙醇配合棉簽、無塵布等工具,清潔樣品台。之後運行PCR儀,設定保持溫度為50℃,約5~10min,讓殘餘液體揮發去除。

另外,熱蓋也應該用酒精或純水定期清洗,確保熱蓋清潔,溫控性能良好。對於熒光定量PCR,清潔樣品台和熱蓋的同時,去除灰塵等雜物,保證光路清潔,降低信號干擾。

3. 使用前預熱

老款的PCR儀的性能比不上新款儀器,使用前需要進行預熱,不僅對儀器維護有好處,還能節約實驗時間。新款的儀器升溫快,但還是建議最好能在進行實驗前預熱2min,這樣可以有效延長儀器的使用壽命。

4. 定期運行維護

1.PCR儀器需要定期檢測,視製冷方式而定一般半年至少一次。

2.PCR反應的要求溫度與實際分布的反應溫度是不一致的,當檢測發現各孔平均溫度差偏離設置溫度大於1~2℃時,可以運用溫度修正法糾正PCR實際反應溫度差。

3.PCR反應過程的關鍵是升、降溫過程的時間控制,要求越短越好,當PCR儀的降溫過程超過60s,就應該檢查儀器的製冷系統,對風冷製冷的PCR儀要較徹底地清理反應底座的灰塵;對其他製冷系統應檢查相關的製冷部件。

4.一般情況如能採用溫度修正法糾正儀器的溫度時,不要輕易打開或調整儀器的電子控制部件,必要時要請專業人員修理或利用儀器電子線路詳細圖紙進行維修。

其他注意事項

另外,由於生產廠家和儀器型號的不同,儀器在保養上也會有差異,有些熒光定量PCR儀,採用底部檢測的模式,平時使用儀器附件中的橡膠風球吹去樣品台上的灰塵等。必要的時候,可以用棉簽沾取無水酒精清潔,但需要注意不要把液體滴入檢測孔中,防止影響裡面的光路部件。

本文整理自:儀器論壇、實驗之家、百度文庫,如侵權請聯繫後台刪除。

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