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多姿多彩的植物非編碼RNA

Science China Life Sciences(《中國科學:生命科學》英文版)2018年第2期出版了「Plant non-coding RNAs and epigenetics」專輯,介紹和探討了植物領域不同類型非編碼RNA及組蛋白修飾和DNA甲基化的作用和機制。專輯特邀編輯為中國科學院上海植物生理生態研究所王佳偉研究員和清華大學戚益軍教授

本期封面取材於中國傳統文化元素——臉譜,通過臉譜的多姿多彩寓意非編碼RNA種類、結構和功能的多樣。封面設計:胡煜

Review

1、microRNA-mediatedRgene regulation: Molecular scabbards for double-edged swords

Deng Yingtian,Liu Minglei,Li Xiaofei,Li Feng(李峰)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),138-147 (2018)

闡述了抗病基因的發現、對作物育種的貢獻及其對植物發育的潛在威脅,總結了植物miRNA對抗病基因的調控作用及其對生物與非生物逆境的響應,指出了靶向抗病基因的miRNA在抗病育種中的潛在應用價值。

2、Grass phasiRNAs and male fertility

Yu Yang,Zhou Yanfei,Zhang Yuchan,Chen Yueqin(陳月琴)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),148-154 (2018)

對近年來禾本科植物phasiRNA的生成機制、種類鑒定和功能研究等方面的進展做了系統性綜述。

3、Transfer RNA-derived small RNAs in plants

Zhu Lei,Ow David W.,Dong Zhicheng(董志誠)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),155-161

綜述了植物中tRNA來源小RNA的研究進展,分析了低等植物中tRNA來源的小RNA,並對其研究進行了展望。

4、RNA editing machinery in plant organelles

Yan Junjie,Zhang Qunxia,Yin Ping(殷平)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),162-169 (2018)

對參與植物細胞器RNA編輯發生的主要編輯因子如PPR蛋白、MORF蛋白等,從結構與功能、複合物組裝與調控等方面進行了綜述和展望。

5、Structure and mechanism of plant histone mark readers

Liu Rui,Li Xueqin,Chen Wei,Du Jiamu(杜嘉木)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),170-177 (2018)

從結構和功能兩方面,對結構已報道的植物組蛋白標記識別因子特異性發揮功能的機理,特別是植物特有的組蛋白識別機制,進行了整理和系統性的總結。

Research Article

6、An expression atlas of miRNAs inArabidopsis thaliana

Xu Le,Hu Yugang,Cao Ying,Li Jingrui,Ma Ligeng,Li Yan,

QiYijun(戚益軍)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),178-189 (2018)

該研究全面和高深度的測序數據為今後更深入地了解miRNAs的功能提供了豐富資源。同時,揭示了成熟miRNA從其前體的哪一臂生成這一過程是受到發育時期及所在器官所調控的。

7、Conservation analysis of long non-coding RNAs in plants

Deng PingchuanLiu ShuNie XiaojunWeining SongWu Liang

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),190-198 (2018)

選取多個典型單子葉和雙子葉植物,從結構和進化方面比較了植物lncRNAs特徵,可為解析植物lncRNAs進化機制和生物學功能提供參考。

8、Arabidopsisnoncoding RNA modulates seedling greening during deetiolation

Wang Yuqiu,Li Jian,Deng Xing-Wang(鄧興旺),Zhu Danmeng

(朱丹萌)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),199-203 (2018)

揭示了高等植物特有的長鏈非編碼RNA HID1在光控植物發育中的新功能:HID1作為負調控因子參與了擬南芥黃化苗子葉見光變綠過程的精細調控。

9、A lariat-derived circular RNA is required for plant development inArabidopsis

Cheng Jinping,Zhang Yong,Li Ziwei,Wang Taiyun,Zhang Xiaotuo,Zheng Binglian(鄭丙蓮)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),204-213 (2018)

通過構建套索RNA過表達的轉基因擬南芥,揭示了套索RNA累積導致植物發育嚴重受阻的轉錄組的分子基礎。

10、EARLY FLOWERING INSHORT DAYS(EFS)regulates the seed size inArabidopsis

Cheng Lingling,Shafiq Sarfraz,Xu Wei,Sun Qianwen(孫前文)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),214-224 (2018)

發現組蛋白甲基轉移酶EFS調節擬南芥種子大小,並影響部分印記基因的表達。

11、Histone 3 lysine 36 to methionine mutations stably interact with and sequester SDG8 inArabidopsis thaliana

Lin Guang,Zhou Ying,Li Min,Fang Yuda(方玉達)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),225-234 (2018)

首次證明植物組蛋白H3K36M突變後能穩定結合組蛋白H3甲基轉移酶SDG8,從而抑制SDG8的正常功能,造成過表達H3K36M植物發育異常。

12、Sumoylation of SUVR2 contributes to its role in transcriptional gene silencing

Luo Yu-Xi,Han Yong-Feng,Zhao Qiu-Yuan,Du Jin-Lu,Dou Kun,Li Lin,Chen She,He Xin-Jian(何新建)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),235-243 (2018)

發現擬南芥中一個參與RNA介導DNA甲基化的重要蛋白SUVR2能夠被SUMO修飾,鑒定了它的修飾位點,並證明了該修飾對SUVR2生物學功能的影響。

13、Comparative WGBS identifies genes that influence non-ripe phenotype in tomato epimutant Colour lessnon-ripening

Chen Weiwei,Yu Zhiming,Kong Junhua,Wang Hui,Li Yichen,Zhao Mei,Wang Xiaohong,Zheng Qianqian,Shi Nongnong,Zhang Pengcheng,Zhong Silin,Hunter Paul,T?r Mahmut,Hong Yiguo

(洪益國)

SCIENCE CHINA Life Sciences61(2),244-252 (2018)

通過全基因組甲基化、轉錄組比較分析及VIGS功能驗證,揭示了LeSPL-CNR及其它基因對番茄表觀遺傳突變體果實不成熟表型的影響。

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