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武漢病毒所揭示兩種高致病性禽流感H5N8病毒的重組類型

編者按:

2月7日,著名學術期刊Nature雜誌旗下Emerging Microbes & Infections發表了中科院流感研究和早期預警中心及武漢病毒所特殊病原體和生物安全重點實驗室的陳全姣研究員團隊的研究論文。該研究揭示了中國中部的濕地和湖泊可能在傳播H5N8病毒上起關鍵作用,闡明了該病毒跨種傳播時氨基酸的變異,且強調了持續監測野鳥和活禽市場中H5N8病毒的必要性。

從2016年起,高致病性禽流感H5N8病毒在中亞候鳥遷徙所經途徑和歐洲出現,造成家禽和野生鳥類大量死亡。在這項研究中,研究者分離和鑒定了來自2016/2017年冬季湖北省的鴻雁和黑天鵝的三種H5N8病毒。全基因組測序和進化分析顯示三種病毒歸類於來自青海湖和歐洲的一組H5N8病毒。從鴻雁分離的一種新的重組病毒與從黑天鵝分離的不同,因為它的PA和NP基因與青海湖病毒不同。分子測定年代顯示這些H5N8病毒的祖先株約出現於2015年7月。通過序列比對,研究者發現在HA和NA上八個氨基酸的替換,在從家禽到野鳥的適應過程中。這三種病毒分離於東亞-大洋洲候鳥遷徙路線上的野鳥,然而,它們的基因組與流行於中亞候鳥遷徙路線上的H5N8病毒相似。從這些數據,研究者總結出中國中部的濕地和湖泊,在傳播H5N8病毒於東亞-大洋洲和中亞候鳥遷徙路線之間上,可能起關鍵作用。

圖1 H5N8病毒的HA和PA基因的最大似然種系發生樹

圖2 H5N8病毒氨基酸替換的SeqLogo分析

【致謝】這項研究由中國科技部關鍵研究和開發項目、國家自然科學基金、武漢國家生物安全四級實驗室開放研究基金項目和深圳科技研究與發展項目提供支持。

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