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SCLS出版新發與繼發病毒專題

儘管在歷史上人類與病毒引起的疾病進行了漫長的鬥爭,但直到19世紀最後幾年,人們才認識到病毒的存在。當時俄羅斯生物學家德米特里·伊萬諾夫斯基(Dmitri Ivanovsky)證明,煙草植物可能被某種「毒素」感染;隨後荷蘭微生物學家馬丁努斯·貝耶林克(Martinus Beijerinck)重新引入了「virus(病毒)」一詞(源自拉丁文「virus」一詞,意為毒藥;現代意義是「導致傳染病的物質」)。隨後隨著病毒分離技術的發展,特別是在20世紀後半葉,人們陸續發現了數千種感染動物、植物和細菌的病毒。近幾十年來,新發與再發可感染人的病毒,對公眾健康構成巨大威脅,並成為全球關注的焦點。

經中國疾病預防控制中心主任高福院士倡議,中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所的劉軍研究員聯合中國科學院微生物研究所劉翟研究員,邀請了中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所梁國棟研究員、段招軍研究員和王大燕研究員,中國科學院上海巴斯德研究所金俠研究員,雲南省衛計委陸林教授,廣州第八人民醫院張復春教授,中國科學院微生物研究所畢玉海副研究員和中國科學院北京生命科學研究院宋豪博士,軍事科學院流行病學研究所姜濤研究員,泰山醫學院史衛峰教授,以及中國科學院武漢病毒所石正麗研究員和崔傑研究員等多位專家學者撰文,探討我國及國際新發和再發病毒相關研究進展,以期為今後新發傳染病的防控和研究提供新的思路和策略。文章集成「Emerging andre-emerging viruses」專題,於近日在Science China Life Sciences(《中國科學:生命科學》英文版)正式刊出。

專題免費下載網址:

http://engine.scichina.com/publisher/scp/journal/SCLS/specialTopics/postArticles/LhN9XhsNCgvZh5DBG

專題文章內容概要

一、我國現代傳染病防控體系

1、 China in action: national strategies to combat against emerging infectious diseases.

Han, M., Gu, J., Gao, G.F.,and Liu, W.J

(INSIGHT)總結了在國家科技重大專項「艾滋病和病毒性肝炎等重大傳染病防治」等項目的長期支持下,我國傳染病防控體系的進步。我國已初步建立以疾控中心為主體的多部門聯防聯控的傳染病應急防控技術體系,並將疾控「關口前移」,保障了非洲乃至「一帶一路」國家人民健康,進入了全球新發突發傳染病防控領導者行列。

2、CASCIRE surveillance network and works on avian influenza viruses

Bi, Y., Shi, W., Chen,J.,Chen, Q., Ma, Z.,Wong, G., Tian, W., Yin, R., Fu, G., Yang, Y., Wang, Q.,He, S., Li, X., Xia, Q., Wang, L., Pan, Z., Li, L., Li, H., Xu, W., Luo, Y.,Zeng, H., Dai, L., Li, X., Liu, Y., Lei, F., Liu, W., and Gao, G.F.

(NEWS AND VIEWS)介紹了中國科學院流感研究與預警中心(CASCIRE)建設的禽流感病毒的生態監測網路(野鳥、家禽、哨點醫院),及其在禽流感病毒監測預警、遺傳進化、致病和跨種傳播機制、防治策略開發等方面的研究進展。以期和國內外研究團隊深入合作,實現新型流感等突發新發傳染病的聯防聯控機制。

二、禽流感

1、Research progress on human infection with avian influenza H7N9 virus.

Tang J. and Wang, D

(REVIEW)從流行病學、病原學、耐藥性及疫苗研發等方面,對自2013年到2017年的五波H7N9禽流感疫情相關科研進展進行了系統綜述。

2、 Phylogenetic and genetic characterization of 2017 clinical isolate of H7N9 virus in Guangzhou, China during the fifth epidemic wave

Deng, Y., Li, C., Han, J.,Wen, Y., Wang, J., Hong, W., Li, X., Liu, Z., Ye, Q., Li, J., Zhou, C., Yu, L.,Qin, C., Zhang, F., and Jiang, T.

(RESEARCH PAPER)研究者從2017年廣州H7N9第五波疫情病例中分離獲得病毒株,並明確了進化關係與基因組特徵,發現其血凝素蛋白存在與禽間高致病性密切相關的重要鹼性氨基酸插入突變(PKRKRTAR/G),為H7N9病毒的持續病原學監測及其在人間流行的風險評估奠定了基礎。

3、Conserved peptides enhance immune efficiency of inactive vaccines against emerging avian influenza viruses in chicken

Xiao, J., Zhang, L., Wang,Z., Xiang, W., Lu, P., Zhao, Y.,Han, M., Ma, A., Qi, P., Wang, M., Gao, G.F.,and Liu W.J.

(RESEARCH PAPER)通過滅活禽流感病毒抗原與多肽表位的聯合應用,比較了不同組別免疫動物的抗體水平和細胞因子水平,篩選到能夠配合禽流感滅活疫苗使用並且具有免疫輔助功能的候選多肽表位。為研發以多肽為主體的禽用滅活苗「佐劑」奠定了基礎,對提升禽用滅活疫苗產品品質具有重要意義。

三、動物宿主及媒介監測

1、Two novel bocaparvovirus species identified in wild Himalayan marmots

Ao,Y., Li, X., Li, L., Xie,X., Jin, D., Lu, S.,and Duan, Z.

(RESEARCH PAPER)利用病毒宏基因組技術在中國青海省野生喜馬拉雅旱獺的肝臟和糞便中發現了兩種博卡病毒新種,並完成了病毒全基因組克隆、注釋和進化分析,為可能出現的動物源性病毒病的預警提供了本底資料。

2、The persistent prevalence and evolution of cross-family recombinant coronavirusGCCDC1 among a bat population: a two year follow-up

Obameso, J.O., Li, H., Jia,H., Han, M., Zhu, S., Huang, C., Zhao, Y.,Zhao, M., Bai, Y.,Yuan, F., Zhao, H.,Peng, X., Xu, W., Tan, W., Yuen, K-Y.,Zhao, Y., Liu, W.J., Lu,L., and Gao G.F.

(RESEARCH PAPER)在前期研究中,報道了在中國雲南的蝙蝠中發現一種新型冠狀病毒Ro-BatCoV GCCDC1,該病毒基因組中重組了一個來源於呼腸孤病毒的p10基因。在本研究中,對該山洞的蝙蝠種群進行了為期2年的監測,結果表明GCCDC1病毒在該蝙蝠種群中持續存在,且p10基因也持續存在於病毒基因組中。同時,該研究也揭示了該病毒存在持續的變異。

3、 Zika virus isolated from mosquitoes: a field and laboratory investigation in China, 2016

Fu, S., Song, S., Liu, H.,Li, Y., Li, X., Gao, X., Xu, Z., Liu, G., Wang, D., Tian,Z., Zhou, J., He, Y.,Lei, W., Wang, H., Wang, B., Lu, X., Liang, G.

(RESEARCH PAPER)2016年首次從中國大陸地區(貴州省德江縣)採集的致倦庫蚊、騷擾阿蚊標本中分離到2株ZIKA病毒,病毒全基因組的分子遺傳進化和特異氨基酸位點分析提示新分離的病毒毒株具有引發ZIKA病毒綜合症的分子基礎。

4、Genome sequencing and phylogenetic analysis of Bannavirus(genus Seadornavirus, family Reoviridae) isolated from Culicoides.

Song, S., Li, Y., Fu,S.,Lei, W., Guo, X.,Feng Y., Gao, X., Li, X., Yang, Z., Xu, Z.,He, Y., Wang,H., Zhou, H., Wang, B., Lu, X., and Liang G.

(RESEARCH PAPER)2012年從中緬接壤地區採集的蠓蟲中分離到一株版納病毒,本研究首次對從蠓蟲標本分離版納病毒進行病毒生物學表型和病毒基因組特徵的分析。填補了從蠓蟲標本分離到版納病毒的分子特性研究的空白。

四、生物信息學

1、Pathogen genomic surveillance elucidates the origins, transmission and evolution of emerging viral agents in China

Shi, W-F., Li, J., Zhou,H., and Gao, G.F.

REVIEW該文概述了病原基因組測序相對於其它病原體檢測技術的優缺點,總結了過去幾年在我國新發和輸入性病毒性病原體溯源、傳播與進化中的應用,並對病原基因組測序在精準傳染病和病毒圈研究中的應用作了展望。

2、Bayesian evolutionary analysis for emerging infectious disease: Anexemplified application for H7N9 avian influenza viruses.

Wei, X., Chen, M., Cui J.

(LETTER TO THE EDITOR)該文主要針對近5年來流行於國內的H7N9禽流感病毒進行進化分析,以貝葉斯原理為骨架,系統的提供了如何分析病毒的發生、散播及進化模式,為新發傳染病的系統分析提供了方法學支持。

五、感染免疫

1、 Both structure and function of human monoclonal antibodies contribute to enhancement of Zika virus infectivityin vitro

Li, M., Wang, X., Wang, Q.,Yu, L., Wang, L., Yan, J., Zhang, F., Zhang, L., Gao, G.F., andJin, X.

(LETTER TO THE EDITOR)該文檢測了從寨卡病毒感染病人體內分離的單克隆抗體在體外引起抗體依賴的增強寨卡病毒感染作用(AED)的能力,並通過分析抗原表位、抗體中和能力與ADE的關係,首次揭示ADE與抗體Log10IC50值呈線性關係,為探究ADE作用機制提供了理論依據,並為體外檢測ADE作用提供了方法學支持。

2、Cross-neutralization of SARS coronavirus-specific antibodies againstbat SARS-like coronaviruses

Zeng, L.P., Ge, X.Y., Peng,C., Tai, W., Jiang, S., Du, L., and Shi, Z.L.

(LETTER TO THEEDITOR)蝙蝠攜帶有遺傳多樣的SARS樣冠狀病毒,其中以WIV1和SHC014為代表的兩個毒株已經被證實具有感染人的潛力。該文發現大部分針對SARS冠狀病毒S蛋白受體結合區的抗體可以中和蝙蝠SARS樣冠狀病毒WIV1毒株,但是不能中和SHC014毒株,暗示我們急需針對以SHC014為代表的毒株開發預防、治療措施。

3、Human T-cell immunity against the emerging and re-emerging viruses

Zhao, M., Zhang, H., Liu,K., Gao, G.F., and Liu W.J.

(REVIEW)該綜述系統總結了近年來新發和再發病毒(如H7N9禽流感病毒、寨卡病毒、中東呼吸綜合征冠狀病毒和埃博拉病毒)的人類T細胞免疫應答特徵的最新進展,闡述了利用MHC四聚體技術研究病毒特異性T細胞免疫的重要意義。

六、蛋白結構及藥物研發

Crystal structure of the C-terminal fragment of NS1 proteinfrom yellow fever virus

Wang, H., Song, H., Qi, J.,Hilgenfeld, R., Shi, Y.,and Gao, G.F.

(LETTER TO THE EDITOR)報道了中國首例死亡黃熱病病例的病毒分離株的NS1蛋白C端晶體結構,發現黃熱病毒NS1的環狀結構表面的電荷分布具有寨卡病毒和西尼羅病毒NS1的雙重特徵,並通過生化實驗和結構解析揭示了黃熱病毒NS1的二聚體形式不太穩定的原因,為進一步闡明不同黃病毒NS1致病機制奠定了基礎。


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