秒殺一切手工畫通路的素材
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02-21
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像這樣的通路圖,基本上都是手工畫的,也有幾個軟體可以做這事,但都不流行,畢竟也沒啥,無非是素材,所以多半還是素材+熟悉的軟體,比如illustrator、fireworks以及最受歡迎的powerpoint。像illustrator很多人已經很熟,或者powerpoint絕對夠傻瓜操作,我們需要的只是素材,自製素材也是可以的,但費時且有時候還不夠好看。很多人還在費力收集網上可以下載到的各種素材,很多素材覆蓋面不夠廣,而不同來源的素材混搭有時候會有種畫風不對的感覺。
今天給大家介紹一個reactome通路所用的素材,reactome目前可能是最大的通路注釋庫了,比KEGG的注釋要全面很多,畢竟KEGG只是代謝通路比較強而已,而reactome的覆蓋面要廣得多,用reactome進行富集分析可以用我的ReactomePA包,和clusterProfiler用法一致,做圖函數共用,你值得一試哦。
reactome的這套素材,去年在一次會議上發布,當時只有300多個圖。
現在已經有接近900個圖了,包含了我們畫通路圖所需要的各種素材,分門別類,我們可以在熟悉的軟體比如illustrator、powerpoint中使用這些素材來畫通路圖。
比如細胞類型:
細胞元件:
轉運/通道蛋白:
甚至於連人體組織都有:
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