會唱歌的80後博導Cell發文：基於網路的單細胞MCA分析

最新 02-24

圖片丨Cell雜誌論文截圖

本研究Highlights

Development of Microwell-seq, a high-throughput and low-cost scRNA-seq platform

Construction of a single-cell mouse cell atlas (scMCA) covering major cell types

Characterization of cellular heterogeneity with minimal batch effect

Characterization of cross-tissue cellular network at the single-cell level

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2018年2月23日，Cell在線發表了一篇來自浙大醫學院的研究論文，題為「Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq」。

研究者為浙大醫學院的80後青年千人郭國驥研究組。

郭國驥實驗室風采（圖片來自實驗室主頁介紹）

很有意思的是實驗室主頁還有一個「大學時期的原創音樂」鏈接，郭sir自編自唱的歌曲，隨便放一首你們感受下，看新聞有次採訪時郭sir還說過曾有演藝公司找他簽約呢。

一個會唱歌的80後博導，我都不想關心cell論文究竟研究了啥，八卦下簡歷先：

2001.9-2005.7 武漢大學學士

2005.8-2010.7 新加坡國立大學博士

2010.8-2010.10 新加坡基因研究所博士後

2010.11-2014.9 哈佛大學醫學院 Research Fellow

2014.10-Current 浙江大學醫學院博士生導師

2014年入職浙江大學醫學院。2015年入選「國家青年千人計劃」，2016年獲「浙江省傑出青年基金」，2017年獲「國家優秀青年基金」。

郭國驥博士，實驗室主頁：http://person.zju.edu.cn/ggj/0.html

「說起我的經歷，可能有點離奇。其實我大學畢業後差一點選擇歌手這個職業。我一直喜歡音樂，自己邊彈吉他，邊搞創作。當年參加「武漢高校原創音樂比賽」，還擠進總決賽，進入了前十強。後來也曾有演藝公司找我簽約。經過仔細斟酌，我決定把科學研究當作我的人生目標，而將音樂視為自己一個興趣愛好。事實證明我當初的選擇是正確的。」

浙大醫學院官網報道

好了好了，正經一點，很多人都已經回來開工了，看看文章講了啥。

作為單細胞分析方面的傑出研究者，郭國驥博士主要利用新一代單細胞分析技術，研究幹細胞增殖和分化、成體細胞去分化和轉分化的分子機制。

例如，2016年的1月份，郭國驥研究組在Cell Reports發文，對小鼠胚胎幹細胞進行了單細胞mRNA-seq分析的文章，發現這些細胞表現出的異質性是血清培養造成的（論文題目：Serum-Based Culture Conditions Provoke Gene Expression Variability in Mouse Embryonic Stem Cells as Revealed by Single-Cell Analysis）

在剛剛發表的這篇論文中，作者建立了基於網路的「單細胞MCA分析」pipeline，利用脂糖構建的微孔陣列和條形碼珠來分析數千個單細胞。

A schematic of the basic workflow for Microwell-seq；在Microwell-seq中，單個細胞被捕獲在瓊脂糖微陣列中，並且mRNA被捕獲在磁珠上；瓊脂糖晶元的尺寸可以通過不同尺寸的PDMS晶元進行調整來適應各種不同大小和濃度的樣本，只需幾分鐘就能製成瓊脂糖chip。

Microwell-seq方法的優勢主要在於成本和便捷性。每個細胞的測序文庫生成成本估計低於0.02美元。