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動物樣品的取樣與保存方法大放送

在微生物測序中,樣本的準備是獲得高質量DNA的前提,而樣本準備也正是讓眾多微生物科研工作者感到困擾的重要一步。

今天就讓小編向您介紹介紹糞便、腸道內容物、腸道黏膜的取樣與保存方式。

一、糞便樣品採集

1、人糞便樣本採集

1)準備好無菌的便盆和糞便容器,洗手,帶上手套收集新鮮的糞便樣本;

2)在實驗室將裝好受試者糞便樣本,立即放在冰上進行分裝並標記;

3)用無菌牙籤或糞便取樣器截取樣品中段里部(糞便表層含有腸粘膜脫落細胞),外部容易污染,且接觸空氣後,部分細菌 DNA 開始降解;

4)用滅菌離心管每管稱取0.5g左右糞便樣本,每個樣本取多管備份,推薦10管;

5)分裝好後,若當天提取DNA,可以先放4 ℃ ,長期存放需先迅速放入液氮中,之後立即放入-80℃保存

6)每次實驗使用一管,未用完丟棄。

註:如糞便樣品量較多或不能馬上收集,最遲要在2小時之內全部收集完。

另附:人類微生物組計劃(HMP)和國際人類微生物組標準(IHMS)的取樣方法

1、準備所需器材

2、貼標籤,標註信息

將標籤紙貼在帶勺糞便採集管(若糞便採集管自帶標籤可不用再貼)及自封袋上。在所有標籤上註明取樣對象信息(姓名、樣本編號、樣本類型、取樣時間等)。

溫馨tips:用透明膠帶在糞便採集管標籤上至少纏繞一圈,並在管蓋上標識名稱,更加保險。

3、收集糞便樣品

將糞便樣本收集系統置於馬桶上,放下馬桶座圈,排便,再將手洗乾淨。

溫馨tips:盡量在收集糞便樣本前將尿液排盡,再將手洗乾淨。

4、取樣

將糞便樣本收集系統的盒子拿出,用勺子截取糞便中段內部一勺(約1g,勺子不要裝得過分滿)

5、裝樣

將勺子垂直放入糞便採集管,擰緊蓋子。

6、重複取樣

一式三份,重複步驟4~5;

7、寄送樣品

將糞便採集管放入自封袋中,液氮速凍後-80 ℃保藏或直接置於乾冰上運輸。

2、小鼠糞便樣本採集

1)將待取樣的小鼠放進乾淨的鋪有消毒濾紙的籠子里,小鼠排便後立即收集糞便樣本。不同的小鼠取樣要更換新的濾紙;

2)單個小鼠用滅菌離心管稱取0.2g樣本,分裝好後立即放入-80℃保存

3)單個小鼠糞便樣本不滿足0.2g,根據課題需求,可以將多個小鼠糞便樣本混合為一個樣品;

4)樣本珍貴,需進行備份。

二、腸道內容物樣品採集與提取

1)在實驗對象死亡後,用無菌解剖刀,在無菌狀態下取出整個腸道,切取所需腸段的內容物(條件允許的話,可在無菌操作台進行);

2)用無菌手術刀挖取內容物,立即放在冰上進行分裝並標記(建議使用乾冰運回實驗室);

3)立即進行DNA抽提。如果不能立即抽提,建議將樣本先置於液氮中冷凍4小時以上,再轉移到-80℃保存

4)單個樣本取樣量:大型動物,如牛、羊500 mg-1000mg/管;中型動物,如大鼠、家兔 200-1000mg/管;小型動物,如小鼠 200-500 mg/管;對於腸道內容物較少動物,如魚、蝦 ≥100 mg/管。為保證實驗順利進行,在採樣允許的情況下,盡量多採集樣品。

推薦試劑盒:QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit 或 OMEGA E.Z.N.A. Stool DNA Ki

三、腸道黏膜採集與提取

1)在無菌環境中將整個腸道移出體外;

2)取不同部位腸段,然後在腸系膜的對面縱向切開,使腸腔外露;

3)用無菌取樣器對內容物進行取樣、保存;

4)將腸道內容物清理乾淨後,用無菌生理鹽水輕輕清洗腸腔,清除看得見的腸容物(避免擾亂腸粘膜);

5)用無菌載玻片輕刮腸道粘膜(避免穿透基底膜)。所有樣品取完後立即放入液氮冷凍,並放在-80℃保存。

推薦試劑盒:MP BIO FASTDNA SPIN Kit for Soil (MP Bio, Santa Ana, CA)

實驗部林愛強 文案

市場部潘旭蘭 編輯

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安捷致善 腸道健康的守護者


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