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高通量代謝組學預測新型抗生素作用原理

高通量代謝組學預測新型抗生素作用原理

大家知道,雖然臨床常用的抗生素已經有耳熟能詳的很多種,但為了提高殺菌效力以及應對越來越多的抗藥病原菌,研發人員們尋找新型抗生素的腳步從未停歇。

得益於化合物有機合成技術的成熟,當下許多新型抗生素的尋找過程基本靠篩。

但是,篩選到療效好的抗生素後,如何快速搞清它們的作用機理?這不僅能幫助人們有目的地尋找更好的候選化合物,也有助於在原化合物基礎上進行合理化學修飾進一步提高療效。

(來自網路)

最新的報道就介紹了一種全局性代謝組學分析技術用來快速預測新型抗菌化合物的作用機理。

研究人員們先用62個已知參考化合物建立了相關抗生素代謝組資料庫,然後試驗分析了212種未知的新型抗結核類分支杆菌化合物。

結果發現,這些新化合物中有70%以上影響了已知的抗生素相關分枝桿菌代謝途徑,只有約8%的新化合物針對非經典細菌代謝過程,暗示發現非傳統新型抗生素具有一定難度。

對於這8%具有新作用方式的抗菌化合物中的6種,人們已經通過代謝組學信息證明,它們影響的是細菌的海藻糖和脂質代謝。

其中一個新型抗菌化合物由上述代謝組學分析所獲得的作用機理也已經在自發耐葯型結核桿菌病原體以及體外化合物-蛋白質組相互作用分析中得到證實。

因此,研究人員們希望,這個新發明的藥物代謝組特徵分析技術將來能幫到抗生素研發領域快速鑒定新型抗生素的抗菌機理,加速新型抗生素乃至其它抗代謝類藥物的開發過程。

原文:Zampieri, M.et al.High-throughput metabolomic analysis predicts mode of action of uncharacterized antimicrobial compounds.Sci Translat Med.2018. DOI: 10.1126/scitranslmed.aal3973

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