科學家鑒定出一種新的控制HIV感染的基因組位點

一些人天然地要比其他人更好地處理HIV感染，但迄今為止，人們僅發現兩個明確的遺傳解釋。2018年3月4日～3月7日在美國馬薩諸塞州波士頓市舉辦的逆轉錄病毒與機會感染會議（Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, CROI）上，一項新的研究發現了第三種遺傳解釋：一種遺傳標記導致更好地控制非洲人後裔中的這種病毒。它可能會闡明這種疾病在未經治療的人群中的進展方式上有時存在著的令人費解的差異，並且可能為開發新的治療策略提供線索。

感染人細胞的HIV，圖片來自NIH。

在一個人感染HIV數周后，血液中的這種病毒水平迅速上升，隨後在免疫反應開始產生後，這種水平下降到一個相對穩定的「設定值（set point）」。較低的設定值帶來了兩種好處：即使沒有接受HIV/AIDS藥物治療，感染者發生更加緩慢的疾病進展，而且他們也不太可能將這種病毒傳染給其他人。根據之前的全基因組關聯研究，在大約25％的時間裡，遺傳因子會導致較低的設定值。

在兩種已知的遺傳因子中，最為強大的遺傳因子來自控制著被稱作人白細胞抗原（HLA）的蛋白產生的基因。不同的HLA決定著一個人對HIV產生的免疫反應強度。第二個遺傳因子存在於天然地抵抗HIV感染的白細胞表面上。HIV需要停靠在兩種不同的受體上才能侵入白細胞，其中的一種受體（被稱作CCR5）發生突變會阻止HIV入侵。

為了查明其他的遺傳因子是否影響HIV設定值，研究人員研究了國際艾滋病毒基因組合作（International Collaboration for the Genomics of HIV, ICGH），其中ICGH包含來自一個登記了全世界大約1.1萬HIV攜帶者的資料庫的遺傳信息和臨床信息。加拿大公共衛生局遺傳學家Paul McLaren說，到目前為止，大多數利用這個資料庫的研究都集中在歐洲人後裔身上。因此，McLaren和他的同事們研究了2517名非洲人後裔。他們發現了第三種遺傳因子發揮作用。

這種被稱作rs77029719的遺傳因子（或者說遺傳標記）存在於1號染色體的一個區域上，這些研究人員將它與較低的HIV設定值相關聯起來。雖然他們沒有發現受影響的基因，但是這個區域在HIV DNA整合到人染色體中發揮著重要的作用，這種整合是HIV生命周期中的一個關鍵步驟。rs77029719存在一個lincRNA中，與4個基因（CHD1L、FMO5、PDIA3P和PRKAB2）的多個變異體中存在著較強的遺傳連鎖性。生物信息學分析提示著rs77029719在調節CHD1L（編碼一種與PARP1相互作用的DNA解旋酶，其中PARP1是一種參與HIV整合的酶）剪接和表達中發揮著作用。有趣的是，rs77029719僅存在於非洲人後裔中，這提示著一種人群特異性的HIV控制機制。

美國塔夫斯大學病毒學家John Coffin說，「這是一個新的真實信號。發現這個區域和與這種關聯性相關的特定突變可能揭示出之前意想不到的病毒-細胞相互作用途徑，而且這兩者都顯著地增強我們對HIV的基礎理解，並且為開發新療法指明方向。」（生物谷 Bioon.com）

參考資料：

New ways to fight HIV and tuberculosis emerge at AIDS conference

Identification of a novel locus of HIV regulation in populations of African descent

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