細胞表面蛋白定量新方法

大家好！今天與大家分享一篇發表在PNAS上的文章「Highly multiplexed and quantitative cell-surface protein profiling using genetically barcoded antibodies」。文章的通訊作者是來自美國加州大學舊金山分校的James Wells教授。Wells教授課題組主要從事蛋白變構效應及激活劑的開發、蛋白酶信號通路以及基於片段的藥物發現等方面的研究。

人類細胞有許多表面蛋白，這些表面蛋白與細胞分型、疾病進程等有著密切的關係。因此，這些蛋白的定量分析備受關注。現有基於蛋白質組學的鑒定方法已經可以很好的完成蛋白鑒定及定量的工作。但是，仍然存在一定的問題，比如價格相對較貴以及單細胞層面鑒定的困境。Wells教授獨闢蹊徑，利用噬菌體展現技術結合二代測序技術解決了蛋白定量的一些問題。

具體來說，Wells課題組開發了一個名叫PhaNGS (phage-antibody next-generation sequencing)的技術。首先他們期待利用基因技術，獲得一系列使噬菌體。這些噬菌體的外殼具有目標蛋白的抗體片段，同時通過突變使其攜帶特異的「基因條碼」。然後通過與細胞共孵育，就可以讓細胞表面的目標蛋白特異性的與其對應的噬菌體結合。最後通過二代測序對結合在細胞上的噬菌體進行測序，就可以得到對應的表面蛋白的相對量。

通過實驗驗證，他們表示PhaNGS技術與蛋白質組學技術的結果具有較高吻合度。他們開發的PhaNGS技術不僅價格低廉，而且可以充分利用成熟的基因測序技術實現單細胞層面的表面蛋白表徵，因此可以為細胞表面蛋白定量及細胞分型等研究提供新的方法。

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