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厲害了腦脊液檢測技術,準確識別肺癌腦轉移瘤突變特徵不再難!

厲害了腦脊液檢測技術,準確識別肺癌腦轉移瘤突變特徵不再難!

腦脊液檢測靈敏度低至0.1%,癌症早篩前景可期!

來源丨醫學界腫瘤頻道

剛剛結束的第十五屆中國肺癌高峰論壇(中國臨床腫瘤學會、中國抗癌協會肺癌專業委員會主辦),聚焦在肺癌臨床前沿話題之一:中樞神經系統轉移:精準診斷,精準治療

厲害了腦脊液檢測技術,準確識別肺癌腦轉移瘤突變特徵不再難!

泛生子首席科學家閻海教授發表主題演講

在閻海教授《揭示深藏在腦部腫瘤中的基因突變與病理機制》的主題演講中,總結了泛生子在過去4年多時間裡積累的近萬例腦部腫瘤及肺癌腦轉移檢測結果以及最新的科研成就,展望了現代科學技術,尤其是基因組學研究在肺癌腦轉移診斷、治療領域的潛在臨床價值。

本文以文字版總結了其中重要內容,以饗讀者。想看閻海教授完整主題演講視頻,可在文末戳閱讀原文哦。

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肺癌腦轉移診療困難重重

20%-65%的肺癌患者在病程中會發生腦轉移。導致肺部腫瘤傾向發生腦轉移的可能機制包括:腫瘤本身的基因背景、血腦屏障、腫瘤免疫微環境、氧氣、代謝、免疫識別等,其中異常緊密的血腦屏障的存在,導致外周血中很難發現肺癌腦轉移的腫瘤細胞及其遺傳信息

通過橫向對比原發腦膠質瘤和繼發肺癌腦轉移瘤的基因特徵、代謝途徑、細胞起源等,可提示不同腦部腫瘤的分子特性及臨床診療策略。泛生子憑藉繼往在膠質瘤診療領域的權威學術積累和臨床轉化成果,將加速推動臨床肺癌腦轉移科學機制的探索與應用轉化。

肺癌腦轉移臨床診治的困難之一,在於轉移灶的異質性非常明顯,這是由於血腦屏障的存在,進入腦部的腫瘤細胞僅為極個別「投機分子」,由於隨機突變的發生和累積,以及轉移微環境的選擇和適應,使得腦部轉移灶形成了不同於肺部原發灶的獨特的分子背景,即所謂的「腫瘤異質性」

此次肺癌腦轉移的臨床診治共識認為,必須同時了解肺部原發灶和腦轉移灶的基因背景,來克服」腫瘤異質性」導致的用藥選擇偏差。

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腦脊液檢測強勢登場,臨床應用優勢顯著

如何有效獲取腦部轉移灶的腫瘤信息?泛生子通過大量的臨床樣本測試,證實腦脊液樣本突變丰度相較於外周血,明顯更接近組織樣本,可更有效的反映腦部轉移瘤的突變特徵

泛生子研發團隊取經國際頂級研究成果,對腦脊液上清提取的CSF cfDNA和腦脊液細胞沉澱提取的CSF pellet DNA進行了對比檢測,發現CSF cfDNA中不同基因檢出的變異頻率明顯高於CSF pellet DNA,在拷貝數變異檢出數目和基因的變異倍數(HER2基因)方面CSF cfDNA也具有顯著優勢。

同時結合泛生子自主研發的超高深度數字測序技術(Ultra-deepDigital Sequencing, UDD-Seq),通過獨特身份標記接頭(雙Barcode)在20000X測序深度下,可達到0.1%的檢測靈敏度,並利用專有生物信息去重演算法,超高保真還原樣本原始片段,杜絕假陽性的檢出,保證腦脊液液態活檢產品的特異性。

厲害了腦脊液檢測技術,準確識別肺癌腦轉移瘤突變特徵不再難!

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分子診斷是大勢所趨

在2008到2009年期間,閻海教授及其團隊首次發現IDH1/2為膠質瘤中最為常見的與代謝改變相關的基因變異,而泛生子接下來將要深入探索的科學問題,是不具有該種變異的肺癌細胞如何適應腦部代謝和免疫微環境

同時,基因組學在腦腫瘤的肺轉移中,泛生子亦曾通過腦脊液檢測,為患者更好的指導了診斷及用藥,延長了生存期。通過腦脊液這種無創檢測手段,我們可對肺癌腦轉移病人進行分子分型、指導其用藥,並進行監測,且可使用這一手段有效幫助相關藥物的研發,將基因組學廣泛應用於癌症的診斷以及治療領域,切實幫助到臨床。

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癌症早篩前景無限,未來可期

在早篩領域,分子手段的應用亦已有突破性進展,閻海教授的導師——來自約翰霍普金斯醫學院著名教授Bert Vogelstein博士及其團隊,已開發了基於遊離DNA和蛋白定量的組合性方法用於早期癌症的發現,並實現精準定位。

相信在不遠的將來,這一技術能夠對人類多種癌症的早期診斷做出顯著貢獻,從而真正實現早期干預,在早期就杜絕癌症的發生。未來,泛生子會繼續與以Bert教授為代表的國內外最頂級的科學家和科研機構緊密合作、共同探索,並攜手臨床專家共同推進癌症早篩研究成果的快速轉化,從而共同完成人類戰勝癌症的光榮使命。

厲害了腦脊液檢測技術,準確識別肺癌腦轉移瘤突變特徵不再難!

厲害了腦脊液檢測技術,準確識別肺癌腦轉移瘤突變特徵不再難!

在媒體專訪環節,閻海教授就行業熱點話題分享了自己的見解。

問:肺癌腦轉移的機制和原因方面有哪些新的進展?對臨床的價值是什麼?

閻海:「肺癌腦轉移」是今天大會的重要主題。肺癌容易發生腦轉移,但腦瘤很少會轉移到肺,這個差異和腫瘤特異的微環境有關係。所以要弄清轉移發生的機制還要對整個腦部生理和病理學有所了解。

肺部原發腫瘤和其轉移瘤在基因突變上有很大區別,所以必須對轉移後的腫瘤進行檢測,了解其特有的分子變化,對腫瘤進行靶向治療。我們和其他同事的前期工作表明,腦脊液液態活檢是一種十分有效的檢測手段,可以發現腦轉移瘤的基因突變, 從而指導臨床治療。

但未來我們還是應該在肺癌的早期發現上研發出更加特異靈敏的方法,早期發現是肺癌治療最為有效的方案。

問:腦部腫瘤近些年來您認為最重要的研究進展有哪些?

閻海:腦部腫瘤是惡性程度非常高的腫瘤,比如膠質瘤,生存情況並不理想。隨著對膠質瘤發生髮展的分子機制和腫瘤分型了解的深入,最近幾年膠質瘤的診斷治療有了很大的突破,現在可以利用基因檢測技術對膠質瘤進行精確的分型,從而對病人預後作出準確判斷,精準指導臨床實驗與治療。

此外,膠質瘤的免疫治療也取得了重大的突破,這些都為膠質瘤患者生存時間和質量的提高帶來很大的益處。

問:NGS在腦腫瘤診療中的價值是什麼?

閻海:長久以來,病理醫生通過在顯微鏡下觀察腫瘤的細胞學形態,判斷膠質瘤的良惡性。但肉眼看到的並不能反映腫瘤特殊的分子機制,而分子機制恰恰是決定腫瘤發生髮展、惡性程度、生物學和病理變化最重要的因素。

如今二代測序技術(NGS)能夠清晰的把腫瘤內部基因的變化展示給醫生和患者,指導治療。相比一代測序,NGS保持了較高的準確性,且具有更加全面、更加高效、更低成本的優點。

2017年FDA批准了FoundationMedicine的NGS panel 檢測方法,用來指導臨床的精準治療,針對特定的靶點或特殊基因變化情況給予靶向或免疫治療。

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