minfi 分析甲基化晶元數據-pipeline篇

對於如何使用 分析甲基化晶元數據，我們在之前的文章中詳細講解了每一步處理的具體用法。今天主要給出一個piepeline, 包括從文件讀取一直到最終的DMP/DMR差異結果。

整個pipeline 可以分成以下幾步：

數據讀取

質量過濾

預處理

探針篩選

差異分析

完整的代碼如下：

總結

通過整個pipeline的代碼，可以看出分析其實並不複雜，關鍵是要理解每個步驟處理的意義和結果的解讀。這裡的代碼並沒有給出一些可視化的圖表結果，其實在中也提供了可視化的解決方案，後面我們再詳細探索。

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